Жобалар

Зерттеулер бағыттары

• Масс-спектрометрия, жүйелік биология (геном-протеом) көмегімен протеомдық зерттеулер;
• Әлеуметтік маңызы бар аурулар мен онкологиялық аурулардың жаңа протеомдық және басқа маркерлерін іздеу, сондай-ақ оларды диагностикалау әдістерін әзірлеу;
• Микроорганизмдердіңантибиотикке төзімділігінің эволюциясыменмеханизмдерінзерттеу;
• Палеопротеомика.

Инновациялық әзірлемелер

• «BirA/BAP1070 және BirA/BAP1108 жұптарын пайдалана отырып, in vivo ақуыз-ақуыз әрекеттесулерін анықтау үшін BirA биотин лигазасы және BAP1070 және BAP1108 биотинді акцепторлық пептидтерді қолдану». Еуразиялық патент No 034880;
• Қазақстандық популяцияда коронарлық артерияларды стенттеуден кейін рестеноздың даму қауіпін диагностикалау әдісі. Қазақстан Республикасының инновациялық патенті No 30963;
• Нақты уақыттағы ПТР көмегімен адамның қан тобын анықтау әдісі. Қазақстан Республикасының инновациялық патенті No 30241;
• мтДНҚ-ның толық геномын анықтау әдісі. Қазақстан Республикасының инновациялық патенті №25562.

Басты басылымдар

Makhammajanov Z., Kabayeva A., Auganova D., Tarlykov P., Bukasov R., Turebekov D., Kanbay M., Molnar M., Kovesdy C., Syed Abidi S., Gaipov A.
Candidate protein biomarkers in chronic kidney disease: a proteomics study // Scientific Reports. ‒ 2024. ‒ Vol.14, №1. ‒ P.14014.

Akhmadi A., Yeskendir A., Dey N., Mussakhmetov A., Shatkenova Z., Kulyyassov A., Andreeva A., Utepbergenov D.
DJ-1 protects proteins from acylation by catalyzing the hydrolysis of highly reactive cyclic 3-phosphoglyceric anhydride // Nature Communications. ‒ 2024. ‒ Vol.15, №1.

Auganova D., Atavliyeva S., Amirgazin A., Akisheva A., Tsepke A., Tarlykov P.
Genomic Characterization of Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis L2/Beijing Isolates from Astana, Kazakhstan // Antibiotics. ‒ 2023. ‒ Vol.12, №10. ‒ P.1523.

Kulyyassov A., Fresnais M., Longuespée R.
Targeted liquid chromatography-tandem mass spectrometry analysis of proteins: Basic principles, applications, and perspectives // Proteomics. ‒ 2021.

Tarlykov P., Atavliyeva S., Auganova D., Akhmetollayev I., Loshakova T., Varfolomeev V., Ramankulov Y.
Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Kazakhstan: evidence for early sheep introduction // Heliyon. ‒ 2021. ‒ Vol.7, №9. ‒ P.e08011.

Tarlykov P., Atavliyeva S., Alenova A., Ramankulov Y.
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. ‒ 2020. ‒ Vol.115, №8. ‒ P.1-6.Genomic analysis of Latin American-Mediterranean family of Mycobacterium tuberculosis clinical strains from Kazakhstan // Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. ‒ 2020. ‒ Vol.115, №8. ‒ P.1-6.

Jurisic A., Robin C., Tarlykov P., Ogryzko V.
Topokaryotyping demonstrates single cell variability and stress dependent variations in nuclear envelope associated domains // Nucleic Acids Research. ‒ 2018. ‒ Vol.46, №22. ‒ P.e135.

Kim E., Rich J., Karoutas A., Tarlykov P., Ogryzko V.
ZNF555 protein binds to transcriptional activator site of 4qA allele and ANT1: potential implication in Facioscapulohumeral dystrophy // Nucleic Acids Research. ‒ 2015. ‒ Vol.43, №17. ‒ P.8227-8242.

Shoaib M., Kulyyassov A., Robin C, Tarlykov P., Despas E., Kannouche P., Ramanculov E., Lipinski M., Ogryzko V.
PUB-NChIP--"in vivo biotinylation" approach to study chromatin in proximity to a protein of interest // Genome Research. ‒ 2013. ‒ Vol.23, №2. ‒ P.331-340.

Maaty W.S., Selvig K., Ryder S. Tarlykov P., Hilmer J., Bothner B.
Proteomic Analysis of Sulfolobus solfataricus during Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus Infection // Journal of Proteome Research. ‒ 2012. ‒ Vol.11, №2. ‒ P.1420-1432.