Проекты

Направления исследований

• Протеомные исследования с использованием масс-спектрометрии, системная биология (геном-протеом);
• Поиск новых протеомных и других маркеров социально-значимых заболеваний и онкозаболеваний, а также разработка методов их диагностики;
• Изучение эволюции и механизмов антибиотикорезистентности микроорганизмов;
• Палеопротеомика.

Инновационные разработки

• «Применение биотин-лигазы BirA и пептидов-акцепторов биотина BAP1070 и BAP1108 для детектирования белок-белковых взаимодействий in vivo с использованием пар BirA/BAP1070 и BirA/BAP1108». Евразийский патент №034880;
• «Способ диагностики риска развития рестеноза в казахской популяции после стентирования коронарных артерий». Патент РК №30963;
• «Способ определения группы крови человека методом ПЦР в реальном времени». Патент РК №30241;
• «Способ определения полного генома мтДНК». Патент РК №25562.

Основные публикации

Makhammajanov Z., Kabayeva A., Auganova D., Tarlykov P., Bukasov R., Turebekov D., Kanbay M., Molnar M., Kovesdy C., Syed Abidi S., Gaipov A.
Candidate protein biomarkers in chronic kidney disease: a proteomics study // Scientific Reports. ‒ 2024. ‒ Vol.14, №1. ‒ P.14014.

Akhmadi A., Yeskendir A., Dey N., Mussakhmetov A., Shatkenova Z., Kulyyassov A., Andreeva A., Utepbergenov D.
DJ-1 protects proteins from acylation by catalyzing the hydrolysis of highly reactive cyclic 3-phosphoglyceric anhydride // Nature Communications. ‒ 2024. ‒ Vol.15, №1.

Auganova D., Atavliyeva S., Amirgazin A., Akisheva A., Tsepke A., Tarlykov P.
Genomic Characterization of Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis L2/Beijing Isolates from Astana, Kazakhstan // Antibiotics. ‒ 2023. ‒ Vol.12, №10. ‒ P.1523.

Kulyyassov A., Fresnais M., Longuespée R.
Targeted liquid chromatography-tandem mass spectrometry analysis of proteins: Basic principles, applications, and perspectives // Proteomics. ‒ 2021.

Tarlykov P., Atavliyeva S., Auganova D., Akhmetollayev I., Loshakova T., Varfolomeev V., Ramankulov Y.
Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Kazakhstan: evidence for early sheep introduction // Heliyon. ‒ 2021. ‒ Vol.7, №9. ‒ P.e08011.

Tarlykov P., Atavliyeva S., Alenova A., Ramankulov Y.
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. ‒ 2020. ‒ Vol.115, №8. ‒ P.1-6.Genomic analysis of Latin American-Mediterranean family of Mycobacterium tuberculosis clinical strains from Kazakhstan // Memorias do Instituto Oswaldo Cruz. ‒ 2020. ‒ Vol.115, №8. ‒ P.1-6.

Jurisic A., Robin C., Tarlykov P., Ogryzko V.
Topokaryotyping demonstrates single cell variability and stress dependent variations in nuclear envelope associated domains // Nucleic Acids Research. ‒ 2018. ‒ Vol.46, №22. ‒ P.e135.

Kim E., Rich J., Karoutas A., Tarlykov P., Ogryzko V.
ZNF555 protein binds to transcriptional activator site of 4qA allele and ANT1: potential implication in Facioscapulohumeral dystrophy // Nucleic Acids Research. ‒ 2015. ‒ Vol.43, №17. ‒ P.8227-8242.

Shoaib M., Kulyyassov A., Robin C, Tarlykov P., Despas E., Kannouche P., Ramanculov E., Lipinski M., Ogryzko V.
PUB-NChIP--"in vivo biotinylation" approach to study chromatin in proximity to a protein of interest // Genome Research. ‒ 2013. ‒ Vol.23, №2. ‒ P.331-340.

Maaty W.S., Selvig K., Ryder S. Tarlykov P., Hilmer J., Bothner B.
Proteomic Analysis of Sulfolobus solfataricus during Sulfolobus Turreted Icosahedral Virus Infection // Journal of Proteome Research. ‒ 2012. ‒ Vol.11, №2. ‒ P.1420-1432.