Бұл жобаның негізгі идеясы Қазақстанда айналымда жүрген Эхинококк қоздырғышының барлық гаплотиптері мен түрлерін анықтау болып табылады. табиғи су қоймалары, ауыл шаруашылығы жануарлары және адамдар арасындағы негізгі таралу жолдарын белгілеу мақсатында дамудың әртүрлі өмірлік кезеңдерінде (аралық және түпкілікті иелері).
Біз экожүйедегі инвазияның таралуы мен берілуінің толық картасын зерттеуге, Қазақстанда кең таралған барлық бар гаплотиптерді егжей-тегжейлі талдауға және сәйкестендіруге әрекет жасадық. Дегенмен, GenBank деректер базасында әртүрлі хосттардан бөлінген патогендік гаплотиптер туралы генетикалық ақпараттың болмауына байланысты бұл жұмысты аяқтау мүмкін емес. Қоздырғыштың гаплоидты генотиптері туралы мәселе үй және ауылшаруашылық жануарлары, сондай-ақ адамдар арасында айналады. Бұл зерттеулер Қазақстан аумағында жүргізілген жоқ.
Молекулярлық генетика және биоинформатика әдістерін қолдана отырып, эхинококкоз қоздырғышының әртүрлі типтерінің гаплотиптерге генетикалық сәйкестігін анықтау.
– Қазақстан аумағында аралық және түпкілікті қожайындардағы эхинококкоз қоздырғышын анықтау үшін биологиялық материал жинау жүргізіледі;
– эхинококкоздың таксономиялық тиістілігі морфометриялық және морфологиялық сипаттамалар негізінде анықталды;
– өмірлік цикл кезеңіне байланысты эхинококкоздың геномдық ДНҚ-сын бөліп алудың хаттамалары мен әдістері жасалып, коллекция жасалды;
– ПТР талдауы жүргізілді және Echinococcus spp. қоздырғышының геномының митохондриялық аймақтарының ампликондары түзілді;
– маркер гендерінің нуклеотидтер тізбегі Sanger секвенирлеу әдісі арқылы дешифрленді және GenBank деректер базасына депозитке салынды;
– биоинформатикалық талдау жүргізіліп, зерттелетін аумақта айналатын эхинококкоз қоздырғышының әртүрлі түрлерінің гаплоидты генотиптері анықталды.
– эхинококкоз қоздырғышының гаплотиптері мен түрлерінің табиғи су қоймалары, ауылшаруашылық жануарлары және адамдар арасындағы негізгі берілу жолдары белгіленді.
Жоба молекулярлық паразитология саласында жоғары білікті мамандарды даярлайды. Ғылым магистрі академиялық дәрежесін алу үшін екі диссертация дайындалады және кем дегенде бір PhD докторын дайындау басталады.
Киян Владимир Сергеевич, PhD докторы, ассоцирленген профессор, Хирш индексі 4, Researcher ID: О-7403-2017, ORCID: 0000-0001-9787-9151, Scopus Author ID: 6701646393.
Абдыбекова Аида Макеновна, Ветеринария ғылымдарының докторы, профессор. Хирш индексі 7, Researcher ID: AAQ-4561-2020, ORCID: 0000-0002-3307-7237, Scopus Author ID: 6507171000
Лидер Людмила Александровна, Ветеринария ғылымдарының кандидаты, доцент. Хирш индексі 2, Researcher ID: O-8442-2017, ORCID: 0000-0001-5842-0751,Scopus Author ID: 56058488900
Смагулова Айнура Муратовна,Техника ғылымдарының магистрі. Хирш индексі 2, Researcher ID: P-7618-2017, ORCID: 0000-0002-3067-3666, Scopus Author ID: 57213811809
Уахит Рабиға Сейтбатталқызы, техника ғылымдарының магистрі. Хирш индексі 1, ORCID: 0000-0001-7737-7162, Scopus Author ID: 57226673682
Леонтьев Сергей Валерьевич, ауыл шаруашылығы ғылымдарының магистрі. ORCID: 0000-0001-7737-7162, Scopus Author ID: 5722667797.
1. Chien-Hung Chen, Vladimir Kiyan, A.A. Zhylkibayev, Dubek Kazyken, Olga Bulgakova, Kent E. Page, Rakhmet I. Bersimbaev, Eric Spooner and Dos D. Sarbassov. Autoregulation of the mTOR Complex 2 integrity is controlled by the ATP-dependent mechanism. J. Biol. Chem. – 2013. – V. 288 (38). – P. 27019-27030. IF-4,65. Q1. Процентиль – 90. DOI: 10.1074/jbc.M113.498055.
2. Kazyken D., Kiyan V., Kaz Y., Zhylkibayev A.A., Chen C-H, Agarwal N.K., Sarbassov D.D. The nuclear import of ribosomal proteins is regulated by mTOR. Oncotarget. – 2014. – Vol. 5 (23). – P. 9577-9593. IF-6.359. Q1. Процентиль – 69. DOI: 10.18632/oncotarget.2473.
3. Bulashev A.K., Borovikov S.N., Serikova S.S., SuranshievZh.A., Kiyan V.S., Eskendirova S.Z. Development of ELISA using anti-idiotypic antibodies for diagnosis of opisthorchiasis. Folia Parasitologica. – 2016. – Р. 63: 025. IF-1.271. Q3. Процентиль – 47. DOI: 10.14411/fp.2016.025.
4. Vladimir S. Kiyan, Aitbay K. Bulashev, Aleksey V. Katokhin. Opisthorchis felineus and Metorchis bilis Metacercariae in Cyprinid Fish Leuciscus idus in Nura-Sarysu River, Kazakhstan. Korean J Parasitol. – 2018. – Vol. 56 (3). – P. 267-274. IF-1,207. Q3. Процентиль – 39. DOI: 10.3347/kjp.2018.56.3.267.
5. Abetov DA, Kiyan VS, Zhylkibayev AA, Sarbassova DA, Alybayev SD, Spooner E, Song MS, Bersimbaev RI, Sarbassov DD. Formation of mammalian pre-ribosomes proceeds from intermediate to composed state during ribosome maturation. J. Biol. Chem. – 2019. – V. 292 (28). – P. 10746-10757. IF-5.157. Q2.Процентиль – 84. DOI: 10.1074/jbc.AC119.008378.
6. Vladimir Kiyan, Aitbay Bulashev, Aibek Zhumalin, Ainura Smagulova, Ludmila Lider. Immunogenicity and Antigenicity of Opisthorchis felineus Proteins. Adv. Anim. Vet. Sci. 2020, 8(9): 933-939. Процентиль – 31. http://dx.doi.org/10.17582/journal.aavs/2020/8.9.933.939.
7. Aiganym Bekenova, Ainura Smagulova, Aleksey Katokhin, Sergei Borovikov, Vladimir Kiyan. Molecular Differential Diagnosis between Opisthorchis felineus and Metorchis bilis. Adv. Anim. Vet. Sci. 2020, 8(s3): 27-32. Процентиль – 31. http://dx.doi.org/10.17582/journal.aavs/2020/8.s3.27.32.
8. Smagulova A., Katokhin A., Mambetpayeva B., Kulmaganbetova N., Kiyan V. A multiplex PCR assay for the differential detection of Opisthorchis felineus and Metorchis bilis. Georgian Medical News No 1 (310) 2021. 176-182. Процентиль – 20. PMID: 33658428.
9. Uakhit RS, Lider LA, Smagulova AM, Leontyev SV, Abdrakhmanov SK, Kiyan VS. First Molecular Identification of Dirofilaria repens Found in a Wolf Heart in Kazakhstan. Adv. Anim. Vet. Sci. 2021, 9(9): 1342-1346. Процентиль – 31. http://dx.doi.org/10.17582/journal.aavs/2021/9.9.1342.1346.
10. Torgerson PR, Shaikenov BS, Baitursinov KK, Abdybekova AM. The emerging epidemic of echinococcosis in Kazakhstan. Trans R Soc Trop Med Hyg. 2002 Mar-Apr;96(2):124-8. IF-5.157. Q2. Процентиль – 84. doi: 10.1016/s0035-9203(02)90276-2.PMID: 12055797.
11. Shaikenov BS, Torgerson PR, Usenbayev AE, Baitursynov KK, Rysmukhambetova AT, Abdybekova AM, Karamendin KO. The changing epidemiology of echinococcosis in Kazakhstan due to transformation of farming practices. Acta Trop. 2003 Feb;85(2):287-93. IF-3.112. Q1. Процентиль – 79. doi: 10.1016/s0001-706x(02)00236-x. PMID: 12606108.
12. Torgerson PR, Shaikenov BS, Rysmukhambetova AT, Ussenbayev AE, Abdybekova AM, Burtisurnov KK. Modelling the transmission dynamics of Echinococcus granulosus in dogs in rural Kazakhstan. Parasitology. 2003 May;126(Pt 5):417-24. IF-3.234. Q1. Процентиль – 74. doi: 10.1017/s0031182003002932. PMID: 12793645.
13. Torgerson PR, Burtisurnov KK, Shaikenov BS, Rysmukhambetova AT, Abdybekova AM, Ussenbayev AE. Modelling the transmission dynamics of Echinococcus granulosus in sheep and cattle in Kazakhstan. Vet Parasitol. 2003 May 30;114(2):143-53. IF-2.738. Q2. Процентиль – 71. doi: 10.1016/s0304-4017(03)00136-5. PMID: 12781476.
14. Abdybekova AM, Torgerson PR. Frequency distributions of helminths of wolves in Kazakhstan. Vet Parasitol. 2012 Mar 23;184(2-4):348-51. IF-2.738. Q2. Процентиль – 71. doi: 10.1016/j.vetpar.2011.09.004. Epub 2011 Sep 12. PMID: 21962968.
15. Abdybekova A., Sultanov A., Karatayev B., Zhumabayeva A., Shapiyeva Z., Yeshmuratov T., Toksanbayev D., Shalkeevand R., Torgerson P.R. Epidemiology of echinococcosis in Kazakhstan: an update //Journal of Helminthology (2015) 89. – P.647-650. IF-1.6. Q2. Процентиль – 68. DOI: 10.1017/S0022149X15000425.
16. Abdybekova A., Sultanov A., Dzhusupbekova N., Abdibayeva A., Zhaksylykova A., Kerimbaeva R., Akhmetova G., Torgerson P.R. Parasites of farmed marals in Kazakhstan // Small Ruminant Research, 153, 2017. – P.142-145. IF-0.947. Q2. Процентиль – 71. DOI: 10.1016/j.smallrumres.2017.06.011.
17. Abdybekova A.M., Zhuangzhi Zhang, Sultanov A.A., Abdibayeva A.A., Zhaksylykova A.A., Junisbayeva S., Aubakirov M., Akhmetova G.D., Torgerson P.R. Genotypes of Echinococcus isolated from domestic livestock in Kazakhstan //Journal of Helminthology, 2019. – P.1-3. IF-1.436. Q2. Процентиль – 68. DOI: 10.1017/S0022149X19000634.
18. Brusentsov I.I., Katokhin A.V., Brusentsova I.V., Shekhovtsov S.V., Borovikov S.N., Goncharenko G.G., Lider L.A., Romashov B.V. et al. Low genetic diversity in wide-spread Eurasian liver fluke Opisthorchis felineus suggests special demographic history of this trematode species. PLoS One. 2013; 8(4):e62453. IF-3.24. Q2. Процентиль – 87. DOI: 10.1371/journal.pone.0062453.
19. Ibrayev B., Lider L., Bauer C. Gasterophilus spp. infections in horses from northern and central Kazakhstan. Vet Parasitol. 2015; 207(1-2):94-98. IF-2.738. Q1. Процентиль – 96. DOI:10.1016/j.vetpar.2014.11.015.
20. Akibekov OS, Lider LA, Odoevskiĭ IM, Tokpan SS, Ospanova AZ. [Immunochemical properties of the excretory-secretory antigen of Trichinella spiralis]. Med Parazitol (Mosk). 2015 Jan-Mar;(1):43-6. Russian. Процентиль – 30. PMID: 25850317.
21. Lider L., Leontyev S., Ussenbayev A., Kiyan V., Akibekov O., Seitkamzina D., ZhanabayevA. Intestinal helminths of wild Canidae from the Kazakhstan steppe ecosystems Veterinaria. 2020; 69(2): P. 111-119. URI: http://repository.kazatu.kz/jspui/handle/123456789/1442
2022 жыл
Қазақстандағы эхинококкоздың аралық және түпкілікті иелерінен биологиялық материал жиналды, биологиялық қауіпсіздіктің жоғары стандарттарына сәйкес 392 сынама алынды. Алынған үлгілер паразитологиялық әдіспен зерттеліп, Echinococcus spp. біріншілік идентификациясы жүргізілді.
Ғылым және жоғары білім беру сапасын қамтамасыз ету комитеті ұсынған отандық басылымдардағы жарияланымдар:
2023 жыл
Биологиялық материалды жинау нәтижесінде адамның 53 оң сынамасы іріктелді, ауылшаруашылық жануарларынан: ірі қара – 1044, ұсақ мал – бауыр мен өкпенің зақымданған мүшелерінен гидатидті кисталардың 693 оң сынамасы. Жиналған 725 ит нәжісінің сынамаларының 30-ында таэниаид жұмыртқалары оң нәтиже берді. Сондай-ақ, сараптама нәтижесінде 120 жабайы жыртқыш (түлкі, қасқыр және қарсақ) эхинококкоз дернәсілімен ауырған.
Жүргізілген жұмыстардың нәтижесінде Echinococcus spp. зерттелген үлгілерінің таксономиясы құрылды, геномдық ДНҚ-ны бөліп алу және ПТР талдауын жүргізу хаттамалары әзірленді, арнайы маркер гендерінің ампликондары әзірленді, тереңірек талдау үшін реттелген болады.
Халықаралық конгрестерге қатысу:
Жоба қызметкерлері 2023 жылғы 27-30 тамыз аралығында И.К.Ахунбаев атындағы Қырғыз мемлекеттік медицина академиясында (Бішкек, Қырғызстан) өткен Эхинококкоз бойынша XXIX Дүниежүзілік конгреске қатысты. Жоба жетекшісі Киян В.С. «Genetic features of echinococcosis common in the Republic of Kazakhstan» тақырыбында ауызша баяндама жасады, жетекші ғылыми қызметкер Абдыбекова А.М. «Қазақстан Республикасы территориясының эхинококкозға эпизоотологиялық сипаттамасы» тақырыбында ауызша баяндама жасады, ғылыми қызметкер Уахит Р.С. «Mocecular genetic identification of Echinococcus spp. found in wolves of Kazakhstan».
Халықаралық конференциялардағы жарияланымдар:
Нұсқаулар:
1 Уахит Р.С., Қиян В.С. Эхинококкоз қоздырғышын генетикалық идентификациялау бойынша әдістемелік ұсыныстар // «Ұлттық биотехнология орталығы» ЖШС, ҚР ДСМ. – Астана, 2023. – 24 б.
2024 жыл
Зерттелетін аумақтың айналымындағы эхинококкоз қоздырғышының гаплоидты генотипін анықтау үшін биоинформатикалық талдау жүргізілді. Сонымен, ірі қара малда 38 гаплотип және G1 және G3 генотиптерінің айналымы, қой арасында 11 гаплотип пен G1/G3 генотипі, адамдарда 9 гаплотип және бір ғана G1 генотипінің айналымы болды. Жабайы жыртқыштарды зерттеу кезінде қасқыр мен қарсақтар G1 генотипі және 7 гаплотипі бар E. granulosus түрі, ал тұлкілерде E. multilocularis түрі анықталды.
Екі маркерлік cox1 және nad1 гендерін қолдану арқылы молекулярлық-генетикалық идентификациялау барысында Қазақстанда алғаш рет түйе мен ірі қара малдан бөлініп алынған қоздырғыштың E. canadensis түріне жататынын анықтау мүмкін болды. Бұл біздің елде E. canadensis түрінің айналымының бар екенін көрсетеді.
Табиғи резервуаларында, ауыл шаруашылығы жануарлары және адамдар арасында эхинококкоз қоздырғышының гаплотиптері мен түрлерінің негізгі берілу жолдары белгіленді. Көрсетілген мәліметтер бойынша, түлкілер мен қарсақтар табиғатта инфекцияның негізгі резервуарларының рөлін атқарып, паразитті қоршаған ортаға нәжіс арқылы таратады. Бұл басқа жануарлардың, соның ішінде үй жануарлары мен адамның жұқтыру қаупін тудырады. Сою кезінде ірі қара мен ұсақ малдың ағзаларында табылған эхинококк кисталары осыны көрсетеді, жұқтыру жабайы жыртқыштар немесе жұқтырылған иттер бөлетін паразит жұмыртқаларымен жанасу арқылы жүретінін көрсетеді Ластанған жайылымдар, су және азық – малға жұғудың негізгі жолдары. Адамдар үшін негізгі қауіп факторлары – ауру иитердің эхинококк жұмыртқаларын жүнінде немесе нәжісінде тасымалдауы себебінен, әсіресе қойшы иттермен байланыс және ластанған өнімдерді тұтыну арқылы жүреді.
Жоба аясында С.Сейфуллин атындағы Қазақ агротехникалық зерттеу университетінде Уахит Р.С. докторантын дайындау аяқталды, 8D138 – «Ветеринария» мамандығы бойынша алдын ала қорғауға құжаттар тапсырылды, ғылыми жетекшілері Киян В.С. және көшбасшы Л.А. Докторанттың жоғары басылымдық белсенділігін ескере отырып, қорғау басылымдар негізінде өткізуге жоспарланады. Сондай-ақ 2023 жылы Астана медицина университетінің 8D05101 – «Биология» мамандығы бойынша докторанты А.К. «Қазақстанда айналымда жүрген эхинококкоз қоздырғышының молекулярлық-генетикалық сипаттамасы» тақырыбына, ғылыми жетекшісі Киян В.С.
Жобаны жүзеге асыру процесінде 6М05100 – «Ветеринариялық биотехнология» (ББТ M082 – Биотехнология) және 7М09101 – Жануарлар ауруларының диагностикасы, емдеу және профилактикасы (ББТ M138 – Ветеринария) білім беру бағдарламаларының магистранттары тартылды. 2024 жылы келесі диссертациялар қорғалды: Джазина К. «Эхинококк қоздырғышының түрлерді анықтаудың молекулярлық-генетикалық әдістері» тақырыбында, PhD ғылыми жетекшісі, доцент Киян В.С., Маннапова Н.Е. «Ақмола облысындағы ауылшаруашылық жануарларында айналатын эхинококк гранулозының генотипі» тақырыбына, жетекшісі: м.ғ.к., доцент Л.А., Олекс И.А. «Иммунды-ферменттік талдауды және имагинальды эхинококкоздың молекулярлық-генетикалық диагностикасын салыстыру» тақырыбына, жетекшісі: м.ғ.д., профессор Абдыбекова А.М.
Қазақстанда түйеде жаңа Echinococcus canadensis түрінің табылуын ескере отырып, жобаның ғылыми тобы ғылыми-зерттеу жұмыстарын кеңейту мақсатында ғылыми және (немесе) ғылыми-зерттеу және ғылыми-техникалық зерттеулерді гранттық қаржыландыру конкурсына қатысуға өтінім дайындады және берді. 2025-2027 жылдарға арналған техникалық жобалар AP26102063 «Қазақстандағы түйе эндопаразиттерінің генетикалық әртүрлілігін талдау және олардың алдын алу және емдеу бойынша ұсыныстар әзірлеу», меңгерушісі б.ғ.к. Смағұлова А.М.
Халықаралық конференцияларға қатысу:
1. Kiyan V., Uakhit R., Smagulova A., Lider L. Genetic features of Echinococcosis common in the Republic of Kazakhstan // International Conference “Astana Biotech 2024”, Astana. – 2024. – Р. 170. https://doi.org/10.11134/btp.3S.2024.158.
2. Uakhit R.S., Lider L.A., Leontyev S.V., Kiyan V.S. Molecular identification of Echinococcus spp.in Kazakhstan wolves // Международная научная конференция «XXIV Сатпаевские чтения», посвященная 125-летию академика Каныша Сатпаева, Павлодар. – 2024. – Т. 13. – С. 340-342.
Отандық рецензияланған журналдардағы жарияланымдар:
1. Джазина К., Уахит Р.С., Киян В. Сравнительный анализ методов выделения ДНК из эхинококковых цист // Научно-практический журнал “Ғылым және білім” Западно-Казахстанского аграрно-технического университета имени Жангир хана. – 2024. – Том 1 (2). – С. 3-11. https://doi.org/10.52578/2305-9397-2024-2-1-3-11. (https://ojs.wkau.kz/index.php/gbj/article/view/1847).
2. Manapov N., Uakhit R., Zholaman S., Smagulova A., Lider L., Kiyan V. Distribution of Echinococcus Granulosus G1 and G3 Genotype Among the Cattle in West-Kazakhstan Region // Journal of Biological Research. – 2024. – Vol. 1(1). – P. 12-18. https://doi.org/10.70264/jbr.v1.1.2024.2.
Халықаралық журналдардағы жарияланымдар:
1. Uakhit R., Yalysheva S., Abdybekova A., Smagulova A., Lider L., Jazina K., Tautanova A., and Kiyan V. Genetic diversity and haplotype analysis of cattle hydatid cyst isolates using mitochondrial markers in Kazakhstan, Veterinary World. – 2024. – Vol. 17(4). – P. 763-770. https://doi.org/10.14202/vetworld.2024.763-770. Q2. Процентиль – 82.
2. Uakhit R., Smagulova A., Lider L., Leontyev S. and Kiyan V. Epizootiological monitoring of wolf helminths in Northern and Central Kazakhstan, Veterinary World. – 2024. – Vol. 17(7). – P. 1648-1654. https://doi.org/10.14202/vetworld.2024.1648-1654. Q2. Процентиль – 82.