AP09260362 «Пестицидтермен ластанған топырақтарды фито-ремедиациялау үшін жоңышқа өсімдіктерін гендік инженерия құру (Medicago Sativa L)»

Өзектілігі

Пестицидтердің топыраққа түсуі олар егістік қабатқа тікелей түскенде немесе топырақтың зиянкестері мен арамшөптерімен күресу үшін топырақ бетін өңдегенде; өңделген тұқымдарды себу; өсімдіктердің әуе бөліктерін тозаңдатқанда және шаңдағанда; ауылшаруашылық және орман алқаптарын әуе өңдеу кезінде; пестицидтерді сақтау және тасымалдау кезінде пайда болады. Сондай-ақ, рұқсат етілмеген, ескірген және пайдалануға жарамсыз тыйым салынған пестицидтерді көму фактілері бар.

Бұзылған экожүйелерді қалпына келтірудің әртүрлі әдістері белгілі. Жақында әлемнің экономикалық дамыған және дамушы елдерінде олар фиторемедиация процестеріне белсенді қатысып қана қоймай, көптеген жағдайларда топырақ микрофлорасына жағымды әсер ететін, табиғи жағдайларды қалпына келтіру процестерінің тиімділігін арттыратын өсімдіктердің көмегімен қоршаған ортаны биологиялық тазартуға жүгінуде. Әлемдік тәжірибе көрсеткендей, гендік инженерия көмегімен пестицидтерді жинақтайтын және оларды зиянсыз күйге келтіретін өсімдіктер құруға болады.

Мақсаты

Пестицидтермен ластанған топырақ фиторемидиациясы үшін генді-инженерлік әдістермен жоңышқа (Medicago Sativa L.) өсімдігін алу болып табылады.

Күтілетін нәтижелер

1. Генетикалық трансформация үшін өсімдік геномында пестицидтермен ластанған топырақтың фиторемедиациясы тиімділігін арттыратын эскпрессиясы бар векторлық құрылым жасау. In vitro жағдайында жоңышқа дақылының (Medicago Sativa L.) соматикалық ұлпаларынан индуцирленген өсімдіктердің морфогенезі мен регеерациясыерекшеліктерін зерттеу.

2. Репортерлі ген көмегімен жоңышқа дақылының agrobacterium-жанамалы трансформация шарттарын оңтайландыру. In vitro жағдайында трансформацияланған жасушалары селекциясы және жоңышқа дақылының трансформацияланған жасушалардан алынған өсімдіктер регенерациясы ерекшеліктерін зерттеу.

3. Пестицидтерді тиімді шоғырландыруға және деградациялатуға қабілетті жоңышқаның генетикалық модификацияланған өсімдігін алу. Пестецидтермен ластанған топырақ үлгісі жағдайында мақсатты ген экспрессиясын зерттеу.

Жоба жетекшісі

Түсіпқан Д., PhD, H-индекс 4. Scopus авторының ID: 57218999913; https://orcid.org/0000-0003-1337-2834.

Зерттеу тобының мүшелері

Манабаева Шұға Асқарқызы, биология ғылымдарының кандидаты

Ахметоллаева Айнаш Серікқызы, биология ғылымдарының магистрі

Рахымжанова Айжан Өсербайқызы, техника және технология магистрі

Рамазанова Малика Бағланқызы, биология ғылымдарының магистрі

Губайдуллин Нұртай Нұрланұлы, бакалавр

Жоба басшысының және зерттеу тобы мүшелерінің жарияланымдары мен қорғау құжаттары

  1. Abeuova L.S., Kali B.R., Rakhimzhanova A.O., Bekkuzhina S.S., Manabayeva Sh.A.  High frequency direct shoot regeneration from Kazakh commercial potato cultivars // PeerJ. –2020. Vol. 2020, Issue 7, 2020, Article number e9447. doi.org/10.7717/peerj.9447Web of Science Q2, Corresponding author
  2. Zhumabek A.T., Rakhimzhanova A.O., Bekkuzhina S.S., Ramankulov Ye.M. and Manabayeva Sh.A. Somatic embryogenesis and plant regeneration from upland switchgrass cultivars // Research on Crops. 2020, – Vol. 21, Issue 2, – P. 349-354. 10.31830/2348-7542.2020.059Web of Science Q4, Corresponding author
  3. Zhumabek A.T., Abeuova L.S., Mukhametzhanov N.S., Scholthof H.B., Ramanculov Е.M., Manabayeva S.A.Transient expression of the bovine leukemia virus envelope glycoprotein gp51 in plants by a recombinant TBSV vector //Journal of Virological Methods. 2018. – Vol. 255. – P. 1-7. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2018.01.016Web of Science Q4, Corresponding author
  4. Manabayeva S.A., Shamekova M., Park J-W., Ding X.S., Nelson R.S., Hsieh Y-C., Omarov R.T., Scholthof H.B. Differential requirements for Tombusvirus coat protein and P19 in plants following leaf versus root inoculation. 2013. Virology. Volume: 439 Issue: 2 Pages: 89-96 http://dx.doi.org/10.1016/j.virol.2018.01.011.Web of Science Q3, First author
  5. Gao S-J, Damaj MB, Park J-W, Beyene G, Buenrostro-Nava MT, Molina J., Wang X., Ciomperlik J. J., Manabayeva S.A., Alvarado V.Y., Rathore K.S., Scholthof H.B., Mirkov E.T. Enhanced Transgene Expression in sugarcane by co-expression of virus-encoded RNA silencing suppressors //PLoS ONE. 2013. Volume: 8. Issue: 6. Pages: 1-13 http://dx.doi:10.1371/journal.pone.0066046 Web of Science Q2.

Сведения об имеющихся патентах и других охранных документах

  1. Манабаева Ш.А., Абеуова Л.С., Раманкулов Е.М. Транзиентная экспрессия генов рекомбинантных белков GFP и Г-КСФ человека в растениях N.benthamiana // Инновационный патент РК. №31056. 16.03.2016.
  2. Манабаева Ш.А., Рахимжанова А.О., Раманкулов Е.М. Способ получения гербицидустойчивых трансгенных растений хлопчатника сорта «Туркистан» // Инновационный патент РК. №31284. 20.06.2016.
  3. Манабаева Ш.А., Жұмабек А.Т., Раманкулов Е.М. Способ транзиентной экспрессии гена рекомбинантного белка β-1,4 эндоглюканазы Е1 в растениях N.benthamiana с помощью вирусного вектора на основе генома ВККТ. Патент РК. № 32592. 12.12.2017

Негізгі нәтижелер

2021

Негізгі нәтижелер: Пестицидтермен ластанған топырақтың фиторемедиациясының тиімділігін арттыратын мақсатты ген ретінде қоян бауырының цитохром P450 cyp2E1 гені таңдап алынды, кДНҚ-дан мақсатты генді синтездеу үшін олигонуклеотидтердің синтезі мен дизайны жасалды. Қоян бауырынан алынған РНҚ матрицасында синтезделген комплементарлы ДНҚ және жоңышқаның компетентті және регенерацияға қабілетті жасушаларына енгізу үшін pSRB-CYP450 экспрессиялық векторы жасалды.  Жоңышқаның отандық сұрыптарының каллусогенезі мен морфогенезінің ерекшеліктері зерттелді. Жоңышқа сұрыптарының эмбриогендік потенциалы эксплант түрлеріне тәуелді емес екендігі анықталды. Құрамында 2,4-Д – 5,0 мг/л, кинетин – 5,0 мг/л және NСҚ – 0,1 мг/л өсу реттегіштері бар В5К II ортасында өсірілген Шортандинская 2 (93%) сұрыпының эксплантаттарында каллусогенездің жоғарғы жиілігі байқалды. Ал құрамында БАП 0,2 мг/л бар В5P I қоректік орта нұсқасы Шортандинская 2 сұрыпында регенерацияның жоғары жиілігін алуға мүмкіндік берді. Генетикалық трансформация бойынша жұмыстарды жүргізу үшін отандық селекцияның жоңышқа сұрыптарының тұқымдарынан өскін регенерациясының тиімді әдісі жасалды.

2022

Негізгі нәтижелер: Agrobacterium-жанама трансформациясына негізделген кәдімгі жоңышқаның гетерогенді каллустары pSRB-CYP450 бинарлы векторымен кодталған репортер генінің көмегімен оңтайландырылды. Шортанды 2 жоңышқа сортының каллусын агробактериалды трансформациялау ко-инокуляция и ко-культивация жасау арқылы жүргізілді. Репортер генінің транзиентті экспрессиясын бақылай отырып, зерттелетін жоңышқа сортының жасушаларының агробактериалды трансформацияға қабілетінің төмендігі анықталды, алайда 100 мкм концентрацияда ацетосирингон, О.П. = 0,3 және бактериямен бірге 48 сағаттық ко-культивация, кәдімгі жоңышқа каллустарының агробактериямен трансформациясы үшін оңтайлы екендігі анықталды. Трансформацияланған жасушалардың селкциясы және кәдімгі жоңышқаның трансформацияланған жасушаларынан өсімдік регенерациясының ерекшеліктерін зерттеу жұмыстары in vitro культурасында жүргізіледі. Фосфинотрицин (PPT) селективті агент ретінде пайдаланылады және селективті агентке төзімділік pSRB-CYP450 құрылымының бөлігі болып табылатын bar генімен қамтамасыз етіледі. Гормоналды құрам бойынша B5 одан әрі оңтайландырылды. Барлығы 126 Петри табақшасы (3000 данадан астам) каллус трансформацияланды, оның 235-і PPT бар селективті ортада некрозға ұшырады. Өсімдік регенерациясы үшін трансформацияланған каллустар қоректік ортаның 4 нұсқасына ауыстырылды. Тәжірибе барысында В5-2 нұсқасы трансформацияланған жоңышқа каллусын регенерациялау үшін ең оңтайлы қоректік орта болып табылатындығы анықталды.

2023

Негізгі нәтижелер: Пестицидтермен ластанған топырақтың фиторемедиациясының тиімділігін арттыратын мақсатты ген ретінде қоян бауырының цитохром P450 cyp2E1 гені таңдап алынды, кДНҚ-дан мақсатты генді синтездеу үшін олигонуклеотидтердің синтезі мен дизайны жасалды. Қоян бауырынан алынған РНҚ матрицасында синтезделген комплементарлы ДНҚ және жоңышқаның компетентті және регенерацияға қабілетті жасушаларына енгізу үшін pSRB-CYP450 экспрессиялық векторы жасалды.Жоңышқаның отандық сұрыптарының каллусогенезі мен морфогенезінің ерекшеліктері зерттелді. Жоңышқа сұрыптарының эмбриогендік потенциалы эксплант түрлеріне тәуелді емес екендігі анықталды. Құрамында 2,4-Д – 5,0 мг/л, кинетин – 5,0 мг/л және NСҚ – 0,1 мг/л өсу реттегіштері бар В5К II ортасында өсірілген Шортандинская 2 (93%) сұрыпының эксплантаттарында каллусогенездің жоғарғы жиілігі байқалды. Ал құрамында БАП 0,2 мг/л бар В5P I қоректік орта нұсқасы Шортандинская 2 сұрыпында регенерацияның жоғары жиілігін алуға мүмкіндік берді. Генетикалық трансформация бойынша жұмыстарды жүргізу үшін отандық селекцияның жоңышқа сұрыптарының тұқымдарынан өскін регенерациясының тиімді әдісі жасалды.Топырақтың пестицидтермен модельденген ластануы жағдайында тұқымның өнуінің ластану дәрежесіне тәуелділігі анықталды. Гендік түрлендірілген жоңышқа өсімдіктеріндегі ХОП құрамын талдау кезінде трансформацияланған өсімдіктердің тамыр бөлігі жерүсті бөлігіне қарағанда салыстырмалы түрде ХОП көбірек жинақталатыны анықталды.Трансгенді жоңышқаның фиторемедиациялық қабілетін талдау нәтижелері psrb-CYP450 бинарлы векторы арқылы түрлендірілген жоңышқа өсімдіктеріндегі cyp2E1 генінің экспрессиясы трансгенді өсімдіктердің тиімділігін арттыруға ықпал ететінін, сонымен қатар пестицидтерді жинақтап, оларды өсімдіктердің тамыр жүйесі арқылы тасымалдауға болатынын көрсетті.

Жобаның нәтижелері бойынша келесі мақалалар жарияланды

  1. Tussipkan Dilnur and Manabayeva Shuga A. Alfalfa (Medicago sativa L.): Genotypic diversity and transgenic alfalfa for phytoremediation // Frontiers in Environmental Science. – 2022, V. 10, p.1-13. https://doi.org/10.3389/fpls.2021.747476  Q1, IF-4,581
  2. Аргумбаева А.К., Рахимжанова А.О., Каканай А.К., Манабаева Ш.А. Особенности индуцированного морфогенеза и регенерации растений из соматических тканей люцерны сортов отечественной селекции в культуре in vitro // Вестник Евразийского национального университета имени Л.Н.Гумилева / Серия биологические науки. – Нур-Султан, 2022. – №2(139). – С.97-106. https://doi.org/10.32523/2616-7034-2022-139-2-97-106