Өзектілігі

Кене арқылы қайталанатын қызба (КҚҚ) – апирексия кезеңдерімен үзілген бірнеше қызба ұстамалары түрінде көрінетін инфекциялық-интоксикациялық синдроммен бірге жүретін RF-боррелиядан (Relapsing Fever Borrelia) туындаған жалпыланған инфекциялар тобы. Емделмеген боррелиоздың негізгі проблемасы-аурудың өткір кезеңінің созылмалы түрге жиі ауысуы. Боррелияда белгілі бір вируленттілік факторларының болуына байланысты оларға иммунитет стерильді емес және қоздырғыш организмде ұзақ уақыт тұра алады. Дұрыс диагноз қою және антибиотиктермен тиісті емдеуді уақтылы бастау өте маңызды, өйткені ауру созылмалы күйге түскеннен кейін оның салдары жалпыланған сипатқа ие болып, пациенттердің мүгедектігіне әкелуі мүмкін.

Біздің елімізде КҚҚ агенттерін тасымалдаушы кенелердің түрлері кең таралған және бұған дейін Шығыс Қазақстанда RF-боррелия өкілдерінің бірінің ДНҚ-ның болуы көрсетілген. Қазақстанның оңтүстік аймағында иксод кенелері де, аргас кенелері де кең таралған. Егер Ixodes persulcatus, B. miyamotoi негізгі әлеуетті тасымалдаушысы, негізінен Іле Алатауы мен Жоңғар Алатауының (Алматы облысы) орманды таулы аймақтарында таралған болса, онда аргас кенелері Ornithodoros spp. және Argas spp. КҚҚ негізгі әлеуетті тасымалдаушылары болып табылатын, негізінен Қазақстанның Түркістан және Жамбыл облыстарының шөлді және шөлейт аймақтарында тұрады. Айта кету керек, ҚР аумағында кенелердің таралу ареалдарын белгілеуге қатысты соңғы ауқымды зерттеулер кеңестік кезеңге (ХХ ғасырдың 70-жылдары) қатысты. Сонымен қатар, соңғы үш онжылдықта ел аумағында климаттың елеулі өзгерістері болды, әсіресе бұл Қазақстанның оңтүстік өңіріне қатысты. Осы жылдар ішінде болған климаттың өзгеруі қауіпті ауруларды тасымалдаушы кенелердің таралу аймағына әсер етуі мүмкін. Бұл әсіресе аргас кенелеріне қатысты, олардың диапазоны орташа жылдық температураның жоғарылауына байланысты солтүстікке қарай кеңейе алады. Осыған байланысты осы жоба барысында алынған Қазақстанның оңтүстік өңірінде аргас және иксод кенелерінің қандай да бір түрлерінің пайда болуы жөніндегі деректер олардың таралуының өзекті ареалдарын түсіну үшін талап етілетін болады.

Қазақстанда кене энцефалиті, риккетсиоз және туляремия сияқты кене арқылы таралатын инфекциялардың мониторингі жақсы жүргізілуде. Кене арқылы берілетін басқа инфекциялар жақсы зерттелмеген. Бұл ретте, Қазақстанда КҚҚ эпидқадағалау жоқ. Қазіргі уақытта әдебиетте B. miyamotoi ДНҚ-сы Қазақстан аумағында ауланған кенелерде анықталатыны туралы ғана айтылады. Қазақстанда RF-боррелийдің басқа өкілдері туралы ақпарат мүлдем жоқ. Аргас кенелерінде боррелий ДНҚ-сының болуы туралы зерттеулер жүргізілген жоқ. Осы боррелиялармен кене инфекциясының деңгейіне, сондай-ақ RF- боррелияларына антиденелердің таралу деңгейіне қатысты ауқымды зерттеулер әлі жүргізілген жоқ.

Жоба шеңберінде алғаш рет қазақстандық RF-боррелий изоляттарына олардың ДНҚ-сын бірнеше геномдық локустар бойынша ішінара секвенирлеу әдісімен генетикалық сипаттама жүргізу жоспарлануда. Бұл ел аумағындағы КҚҚ қоздырғыштарына қатысты филогенетикалық талдау жүргізуге мүмкіндік береді. Сондай-ақ, жобаның мақсаты Қазақстанның оңтүстік өңірінде RF-боррелийлердің таралуын зерттеу, қоздырғышты генотиптеу және елдің оңтүстік өңірі тұрғындарында патогендердің осы тобына антиденелердің серопреваленттілігін анықтау болып табылады. Жұмыс нәтижелері қадағалау стратегиясын негіздеуге, RF-боррелий ДНҚ анықтау әдістерін оңтайландыруға, КҚҚ таралу қаупін азайтуға және Қазақстанда түсініксіз генездің жалпыланған қызбаларын диагностикалаудың тиімділігін арттыруға мүмкіндік береді.

Мақсаты

Жобаның мақсаты Қазақстанның оңтүстік өңірінде RF-боррелиялардың таралуын зерделеу, оларды генотиптеуді жүргізу, елдің оңтүстік өңірі тұрғындарында RF-боррелияларға антиденелердің серопреваленттілігін анықтау және Қазақстан Республикасында инфекциялардың осы тобын эпидемиологиялық қадағалау стратегиясын әзірлеу болып табылады.

Күтілетін нәтижелер

Алынған нәтижелер Қазақстанда КҚҚ үшін эпидемиологиялық енгізуге ықпал ететін болады және елдің оңтүстігінде жүргізілетін қызба диагностикасының сапасын арттыруға тиіс. Жобаны іске асыру барысында алынған нәтижелер Қазақстан аумағында табиғи-ошақты инфекцияларға эпидемиологиялық қадағалауды жетілдіру үшін негіз бола алады, сайып келгенде, азаматтардың әл-ауқатына және денсаулық сақтау саласындағы мемлекет шығындарының төмендеуіне қызмет етеді.

Жобаны іске асыру барысында мынадай тікелей ғылыми нәтижелер алынатын болады:

– КҚҚ негізгі тасымалдаушыларын жинау нүктелерінің ГАЖ-карталары құрылады;

– Қазақстанның оңтүстік өңірінен КҚҚ изоляттары үшін филогенетикалық ағаштар салынады;

– КВЛ жағдайының стандартты анықтамасы әзірленеді (болжамды, ықтимал және расталған жағдай);

– 16S рРНҚ генінің аймағына ұялы ПТР әдісімен RF-боррелийді анықтау үшін жаңа праймерлер әзірленеді;

– Қазақстанда КҚҚ диагностикасының сапасын арттыру үшін дәрігерлерге арналған ұсынымдар әзірленетін болады.

Жоба шеңберінде жүргізілген ғылыми зерттеулердің нәтижелері бойынша жарияланатын болады:

– Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында citescore бойынша процентилі кемінде 35 (отыз бес) болжам бойынша: “Virus Genes” журналында (if 2.10; процентиль 45) рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 3 (үш) мақала және (немесе) шолулар (Scopus); Q4); сондай – ақ ББСҚЕК ұсынған рецензияланатын шетелдік немесе отандық басылымда (болжам бойынша – “ҚазҰУ Жаршысында”) кемінде 1 (бір) мақала немесе шолу. Биологиялық және медициналық Серия”);

– Немесе Web of Science базасында импакт-фактор бойынша 1 (бірінші) және (немесе) 2 (екінші) квартильге кіретін және (немесе) Scopus базасында citescore бойынша кемінде 65 (алпыс бес) процентилі бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 2 (екі) мақала және (немесе)шолулар (болжам бойынша: “Indian Journal of Medical Research, Supplement” журналында (IF 2.90; процентиль 65 (Scopus); Q2 (WoS)).

-Web of Science базасында импакт-фактор бойынша 1 (бірінші) квартильге кіретін және (немесе) Scopus базасында кемінде 80 (сексен) citescore бойынша процентилі бар рецензияланатын ғылыми басылымда 1 (бір) мақаладан немесе шолудан кем емес (болжам бойынша: “PLOS Biology”(IF) журналында 8.029; процентиль 97 (Scopus); Q1 (WoS)).

Жоба жетекшісі

Скиба Ю.А. (1984) – жоба жетекшісі, биология ғылымдарының кандидаты (молекулалық биология), ҰБО АФ директорының орынбасары, молекулалық биология зертханасының меңгерушісі, биологиялық қауіпсіздік офицері. Ғылыми қызығушылық саласы: адам мен жануарлардың аса қауіпті ауруларының қоздырғыштарының дәріге төзімділігінің генетикалық детерминанттарын молекулярлық-генетикалық типтеу және зерттеу, патогендік микроорганизмдердің эволюциясы мен эпидемиологиясы, диагностикалық жүйелердің дамуы, рекомбинантты технологиялар, эукариоттар геномының құрылымдық-функционалдық ұйымдастырылуы, ген экспрессиясын реттеу және генетикалық инженерия. ORCID: 0000-0003-4895-1473. Scopus ID: 56677594900. Researcher ID: H-6528-2017.

Орындау тобының мүшелері

Остапчук Е.О. Жобаның жауапты орындаушысы, РН.D (биология), қауымдастырылған профессор, зертхана меңгерушісі. Ғылыми қызығушылық саласы: молекулалық және жасушалық иммунология, эпидемиология, зооноздық инфекциялар. Табиғи-ошақты зооноздық инфекцияларды зерттеу саласында тәжірибе бар. Қазақстанда кене боррелиозының инфекциялық агенттерін зерттеумен айналысады. ORCID: 0000-0002-3771-423X. Researcher ID: D-1254-2015. Scopus ID: 56823472400

Перфильева Ю.В. Ph.D (иммунология), қауымдастырылған профессор. Молекулалық және жасушалық иммунология маманы. Табиғи-ошақты зооноздық инфекцияларды зерттеу саласында тәжірибе бар. Қазақстанда ку-безгегі мен риккетсиоздың инфекциялық агенттерін зерттеумен айналысады. ORCID: 0000-0001-6803-0773. Researcher ID: AAF-9666-2020. Scopus ID: 56823500600

Жигайлов А.В. Биология ғылымдарының кандидаты (молекулалық биология). Генетикалық инженерия, ген экспрессиясы мен ақуыз биосинтезін реттеудің молекулалық механизмдерін зерттеу, вирустар мен бактериялық кене инфекцияларының генетикалық сипаттамасы саласында маманданған. Кенелерді анықтауға үйретілген. ORCID: 0000-0002-9646-033X. Researcher ID: N-6073-2015. Scopus ID: 6508121286

Дмитровский А.М. Медицина ғылымдарының докторы (эпидемиология, зооноздық инфекциялар), профессор, зертхана меңгерушісі, инфекционист дәрігер. Адамның аса қауіпті зооноздық ауруларын эпидемиология, диагностикалау және емдеу саласындағы маман. Қазақстанда обаның, сібір жарасының, Қырым-Конго геморрагиялық қызбасының, риккетсиоздың, ку-қызбаның таралуын зерттеумен айналысты. ORCID: 0000-0003-4714-3079. Researcher ID: AAZ-2816-2020. Scopus ID: 57204864464

Мамадалиев С.М. (1948) – ветеринария ғылымдарының докторы, профессор, жануарлардың аса қауіпті аурулары бойынша маман. 1992-2010 жылдары С. М. Мамадалиев ҚР БҒМ ҒК “биологиялық қауіпсіздік проблемаларының ғылыми-зерттеу институты” РМК-ны басқарды, ал 2017 жылдан бастап қазіргі уақытқа дейін ҰБО АФ директоры болып табылады. ORCID: 0000-0002-7767-0251. Researcher ID: N-8389-2017. Scopus ID: 37000092700

Мальцева Э.Р. (1983) – PhD-докторант (биотехнология), молекулалық биология саласындағы маман. The АФ ҰБО биоқауіпсіздік және биоқауіпсіздік бөлімінің бастығы және ЦРЛ биологиялық қауіпсіздік офицері болып табылады. Бруцеллез, туберкулез, боррелиоз сияқты адам және жануарлар ауруларының қоздырғыштарын генотиптеумен айналысты. Э. р. Мальцева ЮНЕСКО-ның “Адам және биосфера” бағдарламасы бойынша Ұлттық комитет төрағасының орынбасары. ORCID: 0000-0001-9198-695X. Researcher ID: N-4309-2017. Scopus ID: 57202717826

Низкородова А.С. (1981) – биология ғылымдарының кандидаты (молекулалық биология). Генетикалық инженерия, диагностикалық тест-жүйелерді әзірлеу, микроорганизмдердің нуклеин қышқылдарын анықтау саласында маманданған. ORCID: 0000-0002-1597-7207. Researcher ID: AAY-1646-2020. Scopus ID: 57215971184

Абдолла Н. (1985) – Ph.D (иммунология). Адам мен жануарлар организмдерінің қорғаныс реакцияларының молекулалық механизмдерін зерттеуге маманданған. ORCID: 0000-0002-4769-7824. Researcher ID: R-2193-2016. Scopus ID: 57194001982

Бердыгулова Ж.А. (1985) – Ph.D-докторант (биотехнология), вирусология және молекулалық биология саласындағы маман. Ол патогендік бактериялардың фагтарын зерттеумен, сондай-ақ риккетсия мен боррелийді анықтау және молекулалық сипаттаумен айналысты. ORCID: 0000-0003-0379-2472. Researcher ID: I-2943-2018. Scopus ID: 23977664200

Машжан А.С. (1995) – Ph.D-докторант (биотехнология), микробиология саласындағы маман. Геномдық және метагеномдық зерттеулердің тәжірибесі бар (жаңа буынның реттілігі). ORCID: 0000-0001-6803-0773. Researcher ID: AAF-9666-2020. Scopus ID: 56823500600

Найзабаева Д.А. (1994) – Ph.D – докторант (биотехнология). АФ-да ҰБО биологиялық үлгілерді тіркеу, жылжыту және сақтау бойынша жауапты болып табылады. Жұмыстардың интеграцияланған менеджмент жүйесі мен ISO талаптарына сәйкестігіне жауапты. Қауіпті және аса қауіпті патогендерді генотиптеуде үлкен тәжірибесі бар. ORCID: 0000-0002-0606-4289. Researcher ID: AAY-5696-2020. Scopus ID: 57218288692

Куатбекова С.А. (1992) – магистр, ветеринария саласындағы маман. Адам мен жануарлардың патогендерін анықтау бойынша мониторингтік зерттеулер жүргізуде жұмыс тәжірибесі бар. ORCID: 0000-0002-1091-0150. Researcher ID: ABA-3202-2020

Жоба тақырыбына қатысты жоба жетекшісі мен зерттеу тобы мүшелерінің жарияланымдары мен қорғау құжаттары

1. Skiba, Y. (1-й автор, автор для корреспонденции), Mokrousov I., Nabirova D., Vyazovaya A., Maltseva E., Malakhova, N., Ismagulova G., Pole I., Ranka R., Sapiyeva Z., Ismailov S., Moffett D. Mycobacterium tuberculosis RD-Rio Strain in Kazakhstan. Emerging infectious diseases. 2019;25(3):604–606. https://doi.org/10.3201/eid2503.181179. Q1 (WoS); Scopus – 92%.
2. Zhigailov A.V., Neupokoyeva A.S., Maltseva E.R., Perfilyeva Y.V., Bissenbay A.O., Turebekov N.A., Frey S., Essbauer S., Abdiyeva K.S., Ostapchuk Y.O., Berdygulova Z.A., Aimbetov R.S., Naizabayeva D.A., Dmitrovskiy A.M., Skiba Y.A. (автор для корреспонденции), Mamadaliyev S.M. The prevalence of Borrelia in Ixodes persulcatus in southeastern Kazakhstan. Ticks Tick Borne Dis. 2021;12(4):101716. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2021.101716. Q2 (WoS); Scopus – 92%.
3. Perfilyeva Y.V., Shapiyeva Z.Z., Ostapchuk Y.O., Berdygulova Z.A., Bissenbay A.O., Kulemin M.V., Ismagulova G.A., Skiba Y.A., Sayakova Z.Z., Mamadaliyev S.M., Maltseva E.R., Dmitrovskiy A.M. Tick-borne pathogens and their vectors in Kazakhstan – A review. Ticks Tick Borne Dis. 2020;11(5):101498. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2020.101498. Q2 (WoS); Scopus – 92%.
4. Ostapchuk Y.O., Perfilyeva Y.V., Zhigailov A.V., Maltseva E.R., Neupokoyeva A.S., Bissenbay A.O., Berdygulova Z.A., Naizabayeva D.A., Nizkorodova A.S., Shapiyeva Z.Z., Yegemberdiyeva R.A., Kuznetsova T.V., Kuatbekova S., Akanova A., Ismagulova G.A., Mamadaliyev S.M., Dmitrovskiy A.M., Skiba Y.A. Monitoring of pathogenic Borrelia burgdorferi sensu lato in the Almaty oblast, Kazakhstan. Ticks Tick Borne Dis. 2021;12(4):101725. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2021.101725. Q2 (WoS); Scopus – 92%.
5. Mokrousov I., Vyazovaya A., Sinkov V. Skiba Y. et al. Practical approach to detection and surveillance of emerging highly resistant Mycobacterium tuberculosis Beijing 1071-32-cluster. Sci. Rep. 2021;11:21392. https://doi.org/10.1038/s41598-021-00890-7. Q1 (WoS); Scopus – 93%.
6. Yeh K.B., Tabynov K., Parekh F.K., Maltseva E., Skiba Y., Shapiyeva Z., Sansyzbai A., Frey S., Essbauer S., Hewson R., Richards A. L., Hay J. Building Scientific Capability and Reducing Biological Threats: The Effect of Three Cooperative Bio-Research Programs in Kazakhstan. Frontiers in public health. 2021;9:683192. https://doi.org/10.3389/fpubh.2021.683192. Q1-Q2 (WoS); Scopus – 56%.
7. Mokrousov I., Shitikov E., Skiba Y., Kolchenko S., Chernyaeva E., Vyazovaya A. Emerging peak on the phylogeographic landscape of Mycobacterium tuberculosis in West Asia: Definitely smoke, likely fire. Molecular phylogenetics and evolution. 2017;116:202–212. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2017.09.002. Q2 (WoS); Scopus – 93%.
8. Ostapchuk Y.O., Zhigailov A.V., Perfilyeva Y.V., Shumilina A.G., Yeraliyeva L.T., Nizkorodova A.S., Kuznetsova T.V., Iskakova F.A., Berdygulova Z.A., Neupokoyeva A.S., Mamadaliyev S.M., Dmitrovskiy A.M. Two case reports of neuroinvasive West Nile Virus infection in the Almaty region, Kazakhstan. IDCases. 2020;21:e00872. https://doi.org/10.1016/j.idcr.2020.e00872. Scopus – 25%.
9. Bissenbay, A.O., Zhigailov, A.V., Perfilyeva, Y.V., Naizabaeva D.A., Neupokoyeva A.S., Berdygulova Zh.A., Ostapchuk Ye.O., Maltseva E.R., Kuatbekova S.A., Nizkorodova A., Dmitrovsky A.M., Skiba Y.A., Mamadaliyev, S.M. Epidemiology and molecular genetic characteristics of Lyme borreliosis pathogens circulating in tick’s population in the Almaty oblast of the Republic of Kazakhstan. Zhurnal Mikrobiologii Epidemiologii i Immunobiologii. 2020;97(6):535–545. Scopus – 4%.
10. Mukhatayev Z., Ostapchuk Y.O., Fang D., Le Poole I. C. Engineered antigen-specific regulatory T cells for autoimmune skin conditions. Autoimmunity reviews. 2021;20(3):102761. https://doi.org/10.1016/j.autrev.2021.102761. Q1. Scopus – 92%.

Қол жеткізілген нәтижелер

2022 жыл

Жобаны орындау шеңберінде 2022 жылы тәуекелдерге талдау жүргізілді және Қазақстанның оңтүстік өңірінің аумағын кене арқылы қайтарылатын қызба (КҚҚ) тудыратын RF-боррелияның таралу қаупіне сәйкес аймақтарға бөлу жүргізілді. ҚР-да КҚҚ эпидемиологиялық қадағалау болмағандықтан, аумақты аймақтарға бөлу иксодтық және аргас кенелерінің таралуы, RF-боррелийдің әлеуетті тасымалдаушылары, олардың мекендейтін жерлеріндегі халықтың тығыздығы және соңғы жылдардағы адамдарға шабуыл туралы деректер, КҚҚ тіркелген басқа елдермен шекаралардың болуы, сондай-ақ климаттық және географиялық деректер. Қатты кенелерден туындаған КҚҚ бойынша ең стрессті аймақтар-г. Алматы және Алматы облысының барлық аудандары, Балқаш, (Іле Алатауының төменгі ағысы), Жетісу облысының шығыс аудандары (Жетісу Алатауының төменгі ағысы) және Жетісу облысының Сарқан ауданы. Іле (Шу-Іле тауларының батыс жоталары) және Алматы облысының Балқаш аудандары (Іле өзенінің төменгі ағысында) және оңтүстік аудандардың тау бөктеріндегі аумақтарын қоспағанда, Жамбыл, Түркістан және Қызылорда облыстарының барлық аудандары жұмсақ кенелерден туындаған КҚҚ бойынша шиеленісті аудандар болып табылады. Тәуекелдерді талдау нәтижелері негізінде біз RF-боррелийдің таралуына қатысты ықтимал тәуекелдерді көрсететін ҚР оңтүстік өңірінің аумағын аймақтарға бөлу картасын әзірледік. Серологиялық мониторинг үшін біз Жамбыл облысының 100 шартты дені сау адамынан және Алматы қаласындағы КҚҚ тобының боррелиясынан туындаған симптомдарға ұқсас клиникалық көріністері бар 10 пациенттен сарысу үлгілерін жинадық.

2023 жыл

Жобаны орындау шеңберінде 2023 жылы эпидемиологиялық кезеңге байланысты иксодтық және аргас кенелерін, RF-боррелийдің әлеуетті резервуарларын жинау жүргізілді. 2023 жылғы маусым Жамбыл (193 кене), Алматы (266 кене), Түркістан (1507 кене) және Жетісу (64 кене) облыстарының аумағынан жиналған. Бұл кенелер сақтауға қабылданып,  олар туралы мәліметтер базасы дайындалды. Жиналған кенелерді түрге дейін жүйелі түрде анықтау жүргізілді. Жиналған кенелердің ішінде RF-боррелий қоздырғыштарының 404 потенциалды тасымалдаушысы гомогенизацияланды. Кене гомогенаттарынан жалпы ДНҚ үлгілері оқшауланды және ПТР әдісімен РФ-боррелий ДНҚ-сының болуына талдау жүргізілді, оң үлгінің 3,7% анықталды. Үш RF-боррелий изоляттарына генетикалық сипаттама жасалды. Түркістан облысы Ордабасы ауданында жиналған Argas persicus түріне жататын кенеде анықталған изоляттардың бірі B. anserina жататыны анықталды, Алматы қаласында, Алматы облысында жиналған Ixodes persulcatus түріне жататын кенелерде анықталған тағы екі изолят B. miyamotoi жатады. Сондай-ақ, Серологиялық мониторинг үшін Алматы қаласында (26) және Шымкент қаласында (33) этиологиясы түсініксіз қызбасы бар пациенттерде, сондай-ақ Алматы (82), Түркістан (105) және Жамбыл (142) облыстарында тұратын шартты түрде сау ерікті донорларда қан сарысуының үлгілері жиналды. Түсініксіз этиологиясы бар емделушілерден алынған сарысу үлгілеріне жүргізілген серологиялық талдау боррелийге қарсы IgM класындағы антиденелердің болуына оң үлгілердің 10,2% -. анықтады. Шартты-сау донорлар тобында боррелияға қарсы IgG класындағы антиденелердің болуы бойынша серопреваленттілік 5.8% құрады, оның ішінде Алматы облысында зерттелген іріктемеде 9,8%, Түркістан облысында 1,9% және Жамбыл облысында 6,3%.

Негізгі сындарлы және техникалық экономикалық көрсеткіштер:

-RF-боррелийді анықтау және генетикалық сипаттау үшін синтезделген және тазартылған праймерлер.

– Жоба бойынша жұмыстарды жүргізуге байланысты стандартты операциялық рәсімдер (СОП) әзірленді (2 СОП).

Жоба бойынша жарияланымдар

1. Ostapchuk Y.O., Dmitrovskiy A.M., Pak E.A., Perfilyeva Y.V. A case of combined infection with tick-borne encephalitis and Lyme borreliosis with severe meningoencephalitis and complete recovery // Journal of Global Infectious Diseases. – 2023. – Vol. 15 (2). – P. 81-83. doi:10.4103/jgid.jgid_76_22. (Impact Factor-1.92, Q3 (35.08% Infectious Diseases) Web of Science, Journal Citation Reports, CiteScore – 4.6, Q2 (57% Infectious Diseases) Scopus).

2024 жыл

Кенелер Алматы (57), Алматы (52), Түркістан (131), Жамбыл (279) және Жетісу (66) облыстарында жиналды. Олардың түр деңгейіне морфологиялық идентификациясы жүргізілді, жынысы мен тіршілік циклінің фазасы анықталды. Жиналған кенелерден кене арқылы қайталанатын қызбаның ықтимал векторлары гомогенизацияланды. Жалпы ДНҚ үлгілері кене гомогенаттарынан бөлініп алынды. Күнтізбелік жоспардың осы бөлімі бойынша жұмыстар аяқталды. 2024 жылы жиналған кенелерден бөлініп алынған ДНҚ үлгілері ПТР әдісін қолдана отырып, кене арқылы қайталанатын қызба қоздырғыштарының (RF-боррелия) нуклеин қышқылдарының болуына талдау жасалды. Оң сынамалардың 8%-ы анықталды. 31 RF Borrelia изолятының генетикалық сипаттамасы жүргізілді. Түркістан облысында жиналған Argas persicus кенелерінде анықталған 17 изолят B. anserina, Алматы және Жетісу облыстарында жиналған Ixodes persulcatus түріне жататын кенелерде анықталған басқа 14 изолят B. miyamotoi типіне жататыны анықталды. Қан сарысуының үлгілері дені сау адамдардан және RF-боррелиясынан туындаған клиникалық көріністерге ұқсас пациенттерден алынды. Барлығы 139 сынама жиналды, оның ішінде: Алматы қаласында – 81, Алматы облысында – 33, Жетісу облысында – 23, Түркістан облысында – 2 сынама. Жиналған сынамалардың ішінде 72-сі сау популяциялардан, 8-і клиникалық көріністері және/немесе анамнезінде RF-боррелия тудырған белгілерге сәйкес келетін кене шағуы бар емделушілерден және симптомсыз боррелиоз болған кене шағуы бар науқастардан 59 үлгі алынды. Барлық жиналған үлгілерде боррелия антиденелерінің деңгейі анықталды. 139 үлгі ИФТ әдісімен және 74 үлгі иммунохиппен талданды.

Жобаны жүзеге асыру барысында келесі тікелей ғылыми нәтижелер алынды:

RF-боррелиясын анықтауға және генетикалық сипаттамасына арналған праймерлер синтезделді және тазартылды. Қазақстанның оңтүстік аймағындағы TBRFB изоляттары үшін филогенетикалық ағаштар салынды. Оңтүстік Қазақстандағы ВГВ негізгі векторларын жинау орындарының ГИС картасы құрастырылды.

Алынған нәтижелер бойынша RF-боррелия таралу қаупіне талдау жүргізілді және Қазақстанның жас аймағының аумағы аймақтарға бөлінді және тәуекел картасы жасалды.

Әдебиетті шолу және зерттеу нәтижелері негізінде TBRFB жағдайының стандартты анықтамасы әзірленді: «күдікті», «ықтимал» және «расталған» жағдайлар. TBRFB диагностикасының алгоритмі әзірленді, кене арқылы қайталанатын қызбаларды диагностикалаудың стандартты зертханалық процедуралары әзірленді. Жобалық жұмыстарды орындауға (4 СОП) және TBRFB диагностикасына қатысты стандартты операциялық процедуралар (СОП) әзірленді.

Жоба бойынша жарияланымдар:

1. Kuligin A.V., Lushova A.V., Kan S.A., Bissenbay A.O., Perfilyeva Y.V., Abdolla N., Dmitrovskiy A.M., Skiba Y.A., Ospanbekova N.K., Davlyatshin T.I., Abuova G.N., Bayakhmetova M.M., Adil A.S., Ostapchuk Y.O. Serological survey of Lyme borreliosis in the south region of Kazakhstan // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. – 2024. – Vol. 1. – P. 44–53. https://doi.org/10.11134/btp.1.2024.4. (журнал рекомендован КОКСНВО МНВО РК). (На русском языке: Серологическое обследование на клещевой боррелиоз в южном регионе Казахстана // Евразийский журнал прикладной биотехнологии) (На казахском языке: Қазақстанның оңтүстік аймағындағы кене боррелиозына серологиялық зерттеу // Еуразия қолданбалы биотехнология журналы)
2. Ostapchuk Y.O., Dmitrovskiy A.M., Pak E.A., Perfilyeva Y.V. A case of combined infection with tick-borne encephalitis and Lyme borreliosis with severe meningoencephalitis and complete recovery // Journal of Global Infectious Diseases. – 2023. – Vol. 15 (2). – P. 81-83. doi:10.4103/jgid.jgid_76_22. (Impact Factor-1.92, Q3 (35.08% Infectious Diseases) Web of Science, Journal Citation Reports, CiteScore – 3.5, (48% Infectious Diseases) Scopus). (На русском языке: Коинфекция клещевого энцефалита и тяжелого менингоэнцефалита с Лайм-боррелиозом и полное выздоровление // Глобальный журнал инфекционных заболеваний. На казахском языке: Кене энцефалитімен және ауыр менингоэнцефалитпен Лайма боррелиозымен біріктірілген инфекция және толық сауығу жағдайы // Жаһандық инфекциялық аурулар журналы)
3. Ostapchuk Y.O., Bissenbay A.O., Kuligin A.V., Zhigailov A.V., Perfilyeva Y.V., Kan S.A., Lushova A.V., Stukolova O.A., Sayakova Z.Z., Abdolla N., Dmitrovskiy A.M., Mashzhan A.S., Kuatbekova S.A., Dosmagambet Z., Shapiyeva Zh.Zh., Naizabayeva D.A., Ospanbekova N.K., Yeszhanov A., Akhmetollayev I.A., Skiba Y.A. Survey of tick-borne relapsing fever Borreliae in south and southeastern regions of Kazakhstan // Ticks and tick-borne diseases. – 2024. – Vol. 15 (6). – 102398. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2024.102398 (Impact Factor-3.1, Q2 (61% Infectious diseases) Web of Science, Journal Citation Reports; CiteScore – 6.9, Q1 (91% Insect Science) Scopus). (На русском языке: Исследование клещевого возвратного тифа Borreliae в южных и юго-восточных регионах Казахстана // Клещи и клещевые заболевания. На казахском языке: Қазақстанның оңтүстік және оңтүстік-шығыс аймақтарындағы кене арқылы таралатын рецидивті қызбаның боррелиясын зерттеу // Кене және кене аурулары)
4. Adil A., Dmitrovskiy A., Ospanbekova N., Ostapchuk E., Kuligin A. A clinical case of borreliosis with pneumonia in a patient from an endemic region of Kazakhstan // Proceedings of the International Conference on Clinical and Medical Case Reports. – Barselona, September 9-10. – 2024. – P. 29. (На русском языке: Клинический случай боррелиоза с пневмонией у пациента из эндемичного региона Казахстана // Материалы Международной конференции по клинико-медицинским случаям. На казахском языке: Қазақстанның эндемиялық аймағынан келген науқаста пневмониямен ауыратын боррелиоздың клиникалық жағдайы // Клиникалық және медициналық істер бойынша халықаралық конференция материалдары)
5. Кулигин А.В., Остапчук Е.О., Кан С.А., Лушова А.В., Куатбекова С.А., Скиба Ю.А. Молекулярное исследование боррелий группы возвратных лихорадок в южном регионе Казахстана. // Мат-лы международной конференции “Фундаментальные и прикладные исследования в области молекулярной биологии, биохимии, биотехнологии”. – Алматы, 17 ноября 2023. – С. 27. (тезис). (Қазақстанның оңтүстік аймағындағы қайталанатын безгегі тобының боррелиясын молекулалық зерттеу. // «Молекулярлық биология, биохимия, биотехнология саласындағы іргелі және қолданбалы зерттеулер» халықаралық конференциясының материалдары.)
6. Бисенбай А.О., Остапчук Е.О., Жигайлов А.В., Дмитровский А.М., Скиба Ю.А. Распространенность боррелиозов на Юго-Востоке Республики Казахстана. // Материалы международной конференции “Фундаментальные и прикладные исследования в области молекулярной биологии, биохимии, биотехнологии”. – Алматы, 17 ноября 2023. – С. 22. (тезис). (Қазақстан Республикасының оңтүстік-шығысында боррелиоздың таралуы. // «Молекулярлық биология, биохимия, биотехнология саласындағы іргелі және қолданбалы зерттеулер» халықаралық конференциясының материалдары.)
7. Остапчук Е.O., Бисенбай A.O., Кулигин A.В., Кан С.A., Лушова A.В., Жигайлов A.В., Стуколова O.A., Саякова З.З., Абдолла Н., Дмитровский A.M., Перфильева Ю.В., Машжан A.С., Куатбекова С.A., Досмагамбет Ж., Шапиева Ж.Ж., Найзабаева Д.A., Оспанбекова Н.K., Скиба Ю.A. Исследование распространенности Borrelia miyamotoi в Алматинской и Жетысуской областях Казахстана // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. – 2024. – № 3S. – P. 36. https://doi.org/10.11134/btp.3S.2024.24. (журнал рекомендован КОКСНВО МНВО РК). (Қазақстанның Алматы және Жетісу облыстарында Borrelia miyamotoi таралуын зерттеу // Еуразия қолданбалы биотехнология журналы)

Конференциялардағы баяндамалар (баяндама нысанын көрсете отырып):

1. «Astana Biotech 2024» халықаралық конференциясында «Қазақстанның оңтүстік және оңтүстік-шығыс аймақтарындағы кене боррелиозы» тақырыбындағы панельдік сессияда ауызша баяндама жасау. – Астана, 12-13 қыркүйек – 2024 ж. Баяндамашы: Остапчук Е.О.
2. «Биоқауіпсіздік және тұрақты даму: стратегиялық тәсілдер» халықаралық ғылыми-тәжірибелік симпозиумында «Қазақстанның оңтүстік және оңтүстік-шығыс аймақтарындағы кене ауруының қайталанатын безгегі» тақырыбында панельдік сессияда ауызша баяндама жасау. – Алматы, 24-25 қыркүйек, – 2024. Баяндамашы: Остапчук Е.О.

Халықаралық ынтымақтастық:

1. Орталық эпидемиология ғылыми-зерттеу институтының командасымен ғылыми жоба аясында ғылыми ынтымақтастық, Мәскеу қ., Ресей.