Актуальность

Ретровирусные инфекции птиц наносят значительный урон птицеводству во всем мире за счет инициации онкогенеза, снижения продуктивности и задержки роста. Ретровирусы подавляют иммунитет птиц, повышая их чувствительность к прочим инфекциям, что снижает эффективность иммунизации. Наиболее значимыми для птицеводства являются вирус лейкоза птиц (ALV) и вирус птичьего ретикулоэндотелиоза (REV), характеризующиеся высокой генетической гетерогенностью. Различные генетические группы ALV и REV существенно отличаются по уровню патогенности и инфекционности. В Казахстане не проводится молекулярно-генетический мониторинг ретровирусных инфекций птиц. Для разработки действенных мер контроля необходимо выяснить, какие виды и генетические варианты ретровирусов птиц распространены в Казахстане. Многие виды диких птиц могут быть носителями экзогенных ретровирусов и выступать в качестве природного резервуара инфекции, поэтому мониторинг ретровирусных инфекций желательно проводить и в дикой природе.

Цель

Выяснить, какие ретровирусы и какие их генотипы циркулируют в популяциях домашних и диких птиц на территории Казахстана и разработать эффективные меры по минимизации экономического ущерба от ретровирусных инфекций птиц в стране.

Задачи

1. Провести сбор биологических образцов от домашней птицы с птицефабрик и в хозяйствах населения, провести в них детектирование РНК ретровирусов.
2. Провести молекулярно-генетический мониторинг ретровирусов в популяции диких птиц в рисковых регионах Казахстана.
3. Провести генетическую характеризацию выявленных ретровирусов птиц.
4. Клонировать целевые участки геномов отдельных птичьих ретровирусов.
5. Провести анализ рисков по ALV и REV в Казахстане. Разработать методическое руководство по контролю ALV и REV.

Ожидаемые результаты

Будут установлены генотипы циркулирующих на территории Казахстана птичьих ретровирусов. Будут построены: филогенетические деревья ретровирусов, ГИС-карты сбора образцов, карты рисков для REV и ALV. Будут получены ДНК-конструкции, включающие участки генома отечественных штаммов ретровирусов птиц. Будет выпущено методическое руководство по контролю ALV и REV.

Руководитель проекта

д.в.н., проф., академик НАЕН РК Мамадалиев С.М.

Члены исследовательской группы

1. Мамадалиев Сейдигапбар Мамадалиевич, — д.в.н. (ветеринария), профессор, АФ НЦБ, главный научный сотрудник Лаборатории экспертизы и диагностики АФ НЦБ. Руководитель проекта. Индекс Хирша: 5. ORCID: 0000-0002-7767-0251. Researcher ID: N-8389-2017. Scopus ID: 37000092700.
2. Жигайлов Андрей Викторович, к.б.н., ассоциированный профессор, и.о. заведующего лабораторией молекулярной биологии АФ НЦБ. Ответственный исполнитель проекта. Индекс Хирша: 5. ORCID ID: 0000-0002-9646-033X. Scopus ID: 6508121286. Web of science ID: N-6073-2015.
3. Остапчук Екатерина Олеговна. PhD. Заведующая Лабораторией иммунологии и иммунобиотехнологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 10. ORCID: 0000-0002-3771-423X. Researcher ID: D-1254-2015. Scopus ID: 56823472400.
4. Перфильева Юлия Викторовна. PhD. Ведущий научный сотрудник Лаборатории иммунологии и иммунобиотехнологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 8. ORCID: 0000-0001-6803-0773. Researcher ID: H-5845-2016. Scopus ID: 56823500600.
5. Шин Анна Леонидовна. PhD. Ведущий научный сотрудник Лаборатории молекулярной биологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 6. ORCID: 0000-0001-9911-8233. Scopus ID: 57204860091.
6. Бердыгулова Жанна Амировна, PhD-докторант (биотехнология), старший научный сотрудник Отдела инноваций и разработок АФ НЦБ.  Индекс Хирша: 5. ORCID: 0000-0003-0379-2472. Researcher ID: I-2943-2018. Scopus ID: 23977664200.
7. Машжан Ақжігіт Сембайұлы. PhD. Ведущий научный сотрудник Лаборатории молекулярной биологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 4. ORCID: 0000-0002-9516-5566. Researcher ID: E-2260-2016. Scopus ID: 57211535534.
8. Найзабаева Динара Адамжанқызы, PhD-докторант (биотехнология), научный сотрудник Лаборатории экспертизы и диагностики АФ НЦБ. Индекс Хирша: 3. ORCID: 0000-0002-0606-4289. Researcher ID: AAY-5696-2020. Scopus ID: 57218288692.
9. Прназарова Актолкын Жалгасовна. Научный сотрудник Лаборатории экспертизы и диагностики АФ НЦБ, магистр технических наук (химическая технология органических веществ).
10. Бисенбай Акерке Оңғарбайқызы, PhD-докторант (биотехнология)        АФ НЦБ, научный сотрудник Отдела биобезопасности и биозащиты АФ НЦБ. Индекс Хирша: 3. ORCID: 0000-0002-7109-2534. Researcher ID:  AAХ-9935-2020. Scopus ID: 57217425178.
11. Досанова Айгуль Касимбековна. Научный сотрудник Лаборатории молекулярной биологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 2.
12. Малышева Ангелина Александровна, PhD-докторант (генетика)           , младший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 3. ORCID: 0000-0002-1876-6878. Researcher ID: GPF-4865-2022. Scopus ID: 58522116700.
13. Досмағамбет Жания Маратқызы, магистр (биотехнология), младший научный сотрудник Референтного центра по секвенированию и геномному анализу возбудителей опасных и особо опасных инфекций АФ НЦБ. ORCID: 0000-0001-6681-4865.
14. Иванова Карина Руслановна, магистр (биотехнология), младший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии АФ НЦБ. Индекс Хирша: 1. ORCID: 0000-0002-6096-2880. Researcher ID: JML-6091-2023. Scopus ID: 58521600100.
15. Кулигин Артем Вадимович, магистр (биотехнология), младший научный сотрудник Лаборатория иммунологии и иммунобиотехнологии АФ НЦБ. PhD-студент. Индекс Хирша: 1. ORCID: 0000-0001-5125-3778. Researcher ID: GSE-3325-2022. Scopus ID: 58521988400.

Публикации и охранные документы по теме проекта

Нет

Полученные результаты

2025 год

Проведено выравнивание нуклеотидных последовательностей геномов ретровирусов птиц: REV, ALV и LPDV. Подобраны праймеры и флуоресцентные пробы для выявления/характеризации РНК ретровирусов птиц. Праймеры синтезированы, очищены методом ВЭЖХ, проведен анализ их целостности методом электрофореза в полиакриламидном геле.

Проведен сбор образцов (клоакальные и трахеальные мазки, кровь, образцы печени и почек) от 47 кур с девяти фабрик и 1 птицефермы из Алматинской, Карагандинской, Западно-Казахстанской, Акмолинской, Жетысуской областей и из г.Шымкент.  Проведен сбор образцов (клоакальные и трахеальные мазки, сыворотка крови) от 415 птиц, включая одного гуся и двух мускусных уток.домашней птицы в хозяйствах населения: в Абайской, Жетысуской, Павлодарской, кмолинской, Карагандинской и в Алматинской областях, а также в г. Алматы.

Из биологических образцов выделены РНК Тризолом. Соотношение A₂₆₀/A₂₈₀ всех образцов превышало пороговое значение 1,7. Выделенные РНК тестированы методом классической гнездовой и одностадийной ОТ-ПЦР с использованием видоспецифических праймеров. Все протестированные образцы от кур (412) содержали генетический материал ALV. REV-положительными оказались 29 птицы. Впервые на территории Казахстана выявлены ретровирусы птиц (ALV и REV) как на предприятиях, так и в хозяйствах населения.