Снижение импорта овощных культур, включая томат, является одной из главных задач агропромышленного комплекса страны. Выращивание отечественных сортов томатов, устойчивых к болезням экономически более эффективно и безопасно для окружающей среды. Альтернариоз, вызываемый несколькими видами гриба Alternaria является одним из самых опасных заболеваний во многих районах выращивания томатов по всему миру. Серьезные эпидемии могут привести к полному опадению листьев и значительным потерям урожая от 35 до 80% за короткий период времени. Аналогичная тенденция наблюдается и в Казахстане.
Использование генетических маркеров, которые сцеплены со специфической комбинацией генов или аллелей, обеспечивающих устойчивость растений к болезням, является эффективным инструментом при создании устойчивых сортов. В последнее время SCAR-маркеры являются одними из эффективных инструментов в современной MAS-селекции томатов.
Целью проекта является поиск новых доноров и источников генов устойчивости к альтернариозу томата. Разработка новых SCAR-маркеров, ассоциированных с устойчивостью томата к альтернариозу для создания устойчивых сортов.
Будет проведен сбор и характеристика коллекции сортов и гибридов томатов казахстанской селекции по фенотипическим признакам на опытных полях юго-востока Казахстана. Будет проведен скрининг сортов и гибридов из Казахстана, США и диких видов томатов на устойчивость к альтернариозу на искусственном инфекционном фоне. Будут отобраны устойчивые и восприимчивые к альтернариозу линии для создания генетической сегрегирующей популяции и картирования локусов устойчивости к альтернариозу. Будут проведена гибридизация устойчивых и восприимчивых к альтернариозу линий томатов для создания популяций в поколении F2 или беккросс и картирования генов.
Будет впервые проведено картирование генетических локусов, контролирующих устойчивость томата к альтернариозу на основе технологии BSA-seq. Будут идентифицированы предполагаемые гены-кандидаты устойчивости к альтернариозу с использованием технологии BSA-Seq и других инструментов/ресурсов биоинформатики. Будут протестированы 40 сортов и гибридов томатов казахстанской селекции с SCAR-маркерами, ассоциированных с устойчивостью к альтернариозу.
Будут подготовлены научно-методические рекомендации для использования набора SCAR-маркеров в селекционно-генетических программах.
Какимжанова Алмагуль Апсаламовна, доктор биологических наук. Индекс Хирша — 4. Researcher ID — I-3841-2017 ORCID ID — 0000-0002-7797-6867 Scopus ID — 56031411400
Есимсеитова Асель Кайратовна, 1988 г.р., магистр биологии, научный сотрудник (НС); имеет 25 научных трудов, в том числе в зарубежных рецензируемых научных изданиях в базе Web of Science, Scopus. Индекс Хирша – 1 (Web of Science, Scopus). Researcher ID: P-9837-2017 ORCID: 0000-0002-5428-1915 Scopus ID: 57389169700
Нұртаза Айдана Серікболқызы, 1992 г.р., научный сотрудник (НС), докторант (ЕНУ им. Л.Н. Гумилева, 2018-2021), магистр биологии: имеет 25 научных трудов в области биотехнологии растений, в том числе в зарубежных рецензируемых научных изданиях в базе Web of Science, Scopus. Индекс Хирша – 3 (Web of Science, Scopus). Researcher ID: DKT-7036-2022 ORCID: 0000-0001-6934-3747 Scopus ID: 57389205700
Дюсембекова Дамира Адилевна, 1997 г.р., магистр технологических наук, младший научный сотрудник. Является соавтором 11 публикаций, в том числе в зарубежных рецензируемых научных изданиях в базе Web of Science, Scopus и 1 патента. Индекс Хирша – 3 (Web of Science, Scopus). ORCID: 0000-0002-1621-0577
Проведена фенотипическая характеристика коллекции сортов и гибридов томатов казахстанской селекции и скрининг на устойчивость к альтернариозу, отобраны устойчивые и восприимчивые линии для создания картируемых популяций. Впервые выполнено картирование локусов устойчивости томата к альтернариозу с использованием технологии BSA-seq и идентифицированы предполагаемые гены-кандидаты устойчивости. Проведено тестирование 40 сортов и гибридов томатов с SCAR-маркерами, разработаны научно-методические рекомендации по их применению в селекционных программах.