Актуальность проекта

Центральная Азия, будучи на перекрестке мировых цивилизаций и исторических миграций, является ключевым регионом для понимания генетической истории Евразии. Предыдущие исследования региона выявили высокое генетическое разнообразие Y-хромосомы. Идея нового проекта заключается в определении времени и событий формирования этого разнообразия с помощью исследования новых гаплогрупп Y-хромосомы глубокого разрешения и расширенных ее гаплотипов. Проект нацелен оценить и реконструировать отцовскую генетическую преемственность от древнего населения Центральной Азии до ее современных коренных народов. Проект также исследует вопросы генетической генеалогии патрилинейных племен Центральной Азии.

Цель проекта

Определить вклад мужских линий в формирование генетического разнообразия Центральной Азии на основе анализа гаплогрупп Y-хромосомы глубокого разрешения и расширенных гаплотипов Y-хромосомы.

Ожидаемые результаты

Будет определен вклад мужских линий в формирование генетического разнообразия Центральной Азии на основе анализа гаплогрупп Y-хромосомы глубокого разрешения и расширенных гаплотипов Y-хромосомы. Будет создана база гаплотипов и частот встречаемости гаплогрупп Y-хромосомы в современном и древнем населении Центральной Азии по собственным новым данным и ранее опубликованным данным древней ДНК. Будут изучены вопросы генетической генеалогии патрилинейных племен Центральной Азии.

Проект будет способствовать развитию междисциплинарных исследований (генетики и истории) и международной коллаборации. Проект имеет потенциал для коммерциализации на рынке услуг по генетической генеалогии. Проект соответствует целям конкурса грантового финансирования — повышение уровня научно-исследовательских работ, научно-технического потенциала и конкурентоспособности научных организаций и их коллективов, а также ученых.

Руководитель проекта

Жабагин Максат Кизатович, PhD, ассоциированный профессор

Scopus Author ID: 56590111900

Члены исследовательской группы

Дюсенова Ж.С., Специалист в области криминалистической генетики (Целиноградский государственный медицинский институт, Казахстан). Направления научных интересов: криминалистическая генетика.

Тажигулова И.М., Бакалавр в области биологии (Карагандинского государственного университета имени Е.А.Букетова, Казахстан), магистр в области криминалистической генетики и криминалистической генетики (Карагандинского государственного университета имени Е.А.Букетова, Казахстан и Королевский колледж Лондона, Великобритания). Направления научных интересов: криминалистическая генетика.

Букаев А.А., Бакалавр в области биологии (Казахский агротехнический исследовательский университет имени С.Сейфуллина, Казахстан), магистр в области криминалистики (Евразийский национальный университет имени Л.Н. Гумилева, Казахстан). Направления научных интересов: криминалистическая генетика.

Букаева А.Т., Бакалавр в области биологии (Евразийский национальный университет имени Л.Н. Гумилева, Казахстан), магистр в области (Евразийский национальный университет имени Л.Н. Гумилева, Казахстан). Направления научных интересов: популяционная генетика человека.

Файзов Б.К., магистрант 2 курса в области биологии (Евразийский национальный университет имени Л.Н. Гумилева, Казахстан). Направления научных интересов: популяционная генетика человека.

Публикации и охранные документы руководителя проекта и членов исследовательской группы по теме проекта

1. Ashirbekov Y, Seidualy M, Abaildayev A, Maxutova A, Zhunussova A, Akilzhanova A, Sharipov K, Sabitov Z, Zhabagin M. Genetic polymorphism of Y-chromosome in Kazakh populations from Southern Kazakhstan. BMC Genomics. 2023 Oct 27;24(1):649. doi: 10.1186/s12864-023-09753-z. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Category: Genetics & Heredity– Q1)
2. Ashirbekov Y, Nogay A, Abaildayev A, Zhunussova A, Sabitov Z, Zhabagin M. Genetic polymorphism of 27 Y-STR loci in Kazakh populations from Eastern Kazakhstan. Ann Hum Biol. 2023 Feb;50(1):48-51. doi: 10.1080/03014460.2023.2170465. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Anthropology – Q2)
3. Zhabagin M, Wei LH, Sabitov Z, Ma PC, Sun J, Dyussenova Z, Balanovska E, Li H, Ramankulov Y. Ancient Components and Recent Expansion in the Eurasian Heartland: Insights into the Revised Phylogeny of Y-Chromosomes from Central Asia. Genes 2022, 13(10), 1776; https://doi.org/10.3390/genes13101776. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Category: Genetics & Heredity– Q2)
4. Ashirbekov Y, Sabitov Z, Aidarov B, Abaildayev A, Junissova Z, Cherusheva A, Saidamarova VV, Sharipov K, Ramankulov Y, Zhabagin M. Genetic Polymorphism of 27 Y-STR Loci in the Western Kazakh Tribes from Kazakhstan and Karakalpakstan, Uzbekistan. Genes. 2022; 13(10):1826. doi:10.3390/genes13101826. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Category: Genetics & Heredity– Q2)
5. Ashirbekov Y, Abaildayev A, Neupokoyeva A, Sabitov Z, Zhabagin M. Genetic polymorphism of 27 Y-STR loci in Kazakh populations from Northern Kazakhstan. Ann Hum Biol. 2022 Mar 7:1-3. doi: 10.1080/03014460.2022.2039292. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Anthropology – Q2)
6. Kairov U, Molkenov A, Sharip A, Rakhimova S, Seidualy M, Rhie A, Kozhamkulov U, Zhabagin M, Kim JI, Lee JH, Terwilliger JD, Seo JS, Zhumadilov Z, Akilzhanova A. Whole-Genome Sequencing and Genomic Variant Analysis of Kazakh Individuals. Front Genet. 2022 Jul 11;13:902804. doi: 10.3389/fgene.2022.902804. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2022 – Category: Genetics & Heredity– Q2)
7. Zhabagin M, Sabitov Z, Tazhigulova I, Alborova I, Agdzhoyan A, Wei LH, Urasin V, Koshel S, Mustafin K, Akilzhanova A, Li H, Balanovsky O, Balanovska E. Medieval Super-Grandfather founder of Western Kazakh Clans from Haplogroup C2a1a2-M48. J Hum Genet. 2021 Jan 29. doi: 10.1038/s10038-021-00901-5. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2021 – Category: Genetics & Heredity– Q2)
8. Seidualy M, Blazyte A, Jeon S, Bhak Y, Jeon Y, Kim J, Eriksson A, Bolser D, Yoon C, Manica A, Lee S, Bhak J. Decoding a highly mixed Kazakh genome. Hum Genet. 2020 May;139(5):557-568. doi: 10.1007/s00439-020-02132-8. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2020 – Category: Genetics & Heredity– Q1)
9. Zhabagin M, Sabitov Z, Tarlykov P, Tazhigulova I, Junissova Z, Yerezhepov D, Akilzhanov R, Zholdybayeva E, Wei LH, Akilzhanova A, Balanovsky O, Balanovska E. The medieval Mongolian roots of Y-chromosomal lineages from South Kazakhstan. BMC Genet. 2020 Oct 22;21(Suppl 1):87. doi: 10.1186/s12863-020-00897-5. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2021 – Category: Genetics & Heredity– Q3)
10. Zhabagin M, Sarkytbayeva A, Tazhigulova I, Yerezhepov D, Li S, Akilzhanov R, Yeralinov A, Sabitov Z, Akilzhanova A. Development of the Kazakhstan Y-chromosome haplotype reference database: analysis of 27 Y-STR in Kazakh population. Int J Legal Med. 2019 Jul;133(4):1029-1032. doi: 10.1007/s00414-018-1859-8. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2019 – Category: Medicine, Legal – Q1)
11. Zhabagin M, Balanovska E, Sabitov Z, Kuznetsova M, Agdzhoyan A, Balaganskaya O, Chukhryaeva M, Markina N, Romanov A, Skhalyakho R, Zaporozhchenko V, Saroyants L, Dalimova D, Davletchurin D, Turdikulova S, Yusupov Y, Tazhigulova I, Akilzhanova A, Tyler-Smith C, Balanovsky O. The Connection of the Genetic, Cultural and Geographic Landscapes of Transoxiana. Sci Rep. 2017 Jun 8;7(1):3085. doi: 10.1038/s41598-017-03176-z. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2017 – Category: Multidisciplinary – Q1)
12. Balanovsky O, Zhabagin M, Agdzhoyan A, Chukhryaeva M, Zaporozhchenko V, Utevska O, Highnam G, Sabitov Z, Greenspan E, Dibirova K, Skhalyakho R, Kuznetsova M, Koshel S, Yusupov Y, Nymadawa P, Zhumadilov Z, Pocheshkhova E, Haber M, Zalloua PA, Yepiskoposyan L, Dybo A, Tyler-Smith C, Balanovska E. Deep phylogenetic analysis of haplogroup G1 provides estimates of SNP and STR mutation rates on the human Y-chromosome and reveals migrations of Iranic speakers. PLoS One. 2015 Apr 7;10(4):e0122968. doi: 10.1371/journal.pone.0122968. (Web of Science Rank by Journal Impact Factor 2015 – Category: Multidisciplinary – Q1)

Достигнутые результаты

2024 г.

Собраны образцы ДНК в популяциях современного населения Центральной Азии. Для выполнения задачи из коллекций биобанка коллабораторов собраны туркмены (100), уйгуры (200), узбеки (200), киргизы (200) и казахи (200).  Определены расширенные гаплотипы Y-хромосомы для собранных образцов ДНК из популяций современного населения Центральной Азии с использованием амплификации ПЦР (полимеразной цепной реакции)  в реакционной смеси системы Microreader™ Y Prime Plus или PowerPlexY23System, которые включают в себя 17 стандартных Y-STR маркеров (DYS19, DYS385 a/b, DYS389I/II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448, DYS456, DYS458, DYS635, Y-GATA-H4), и расширенные быстромутирующие локусы (RM).