Лаборатория геномики растений и биоинформатики

Заведующий лабораторией

 

КАЛЕНДАР РУСЛАН НИКОЛАЕВИЧ

 
Кандидат биологических наук,
доцент генетики (университет Хельсинки)
 

 

Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
+7(7172) 70 75 17

 
 

Специалист в области молекулярной биологии и генетики, биоинформатики. Автор более 80 научных трудов, 4 патентов, 2 монографий, 2 учебных пособий, более 50 тезисов и 6 компьютерных программ. Редакционная коллегия научных журналов:AcademicEditor, PLOS ONE (eISSN-1932-6203); член редколлегии «Биотехнология. Теория и практика» (ISSN 1028-9399); Editor, Repbase Update [http://www.girinst.org/repbase/]. Рецензент научных журналов: ActaPhysiologiaePlantarum, Annals of Botany, Australian Journal of Crop Science, Bioinformatics, BiologiaPlantarum, BioMed Research International, BMC Genomics, Chromosome Research, Czech Journal of Genetics and Plant Breeding, Electrophoresis, FEMS Microbiology Letters, Genes & Genetic Systems, Genetica, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, International Journal of Plant Genomics, Journal of Agricultural Science and Technology (JAST), Mobile DNA, Molecular Biology Reports, Molecular Breeding, Molecular Ecology, Molecular Genetics and Genomics, New Phytologist, Nucleic Acids Research, Plant Cell Reports, Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization, Plant Methods, Plant Molecular Biology Reporter, Plant Systematics and Evolution, PLOS ONE, Theoretical and Applied Genetics, Tree Genetics & Genomes.

Направления исследованийОсновные публикацииИнновационные разработкиПредоставление услуг
  • Молекулярно-генетические исследования геномов растений, сравнительный анализ геномов и геномика;
  • Синтетическая биология и биоинформатика (разработка компьютерных программ, поиск повторов, выравнивание и кластеризации ДНК последовательностей и ПЦР методов), создание базы данных и программного обеспечения для сравнительного анализа исследуемых генов и геномов;
  • Исследования альтернативного сплайсинга и полиморфизма интронов;
  • Исследования мобильных элементов (ретротранспозонов, транспозонов) и применение их для молекулярно-генетических и эволюционных исследований.
 
  • Kalendar R, Lee D, Schulman AH

    FASTPCR software for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis. Methods in Molecular Biology series: DNA Cloning and Assembly Methods, e. ed. Valla S., Lale R., – 2014, 1116: 271-302. ISBN 978-1-62703-763-1. DOI: 10.1007/978-1-62703-764-8_18

  • Kalendar R, Schulman AH 

    Transposon based tagging: IRAP, REMAP, and iPBS. Methods in Molecular Biology series: Molecular Plant Taxonomy. Protocols and applications, ed. Besse P., – 2014, 1115: 233-255. ISBN 978-1-62703-766-2. DOI: 10.1007/978-1-62703-767-9_12

  • Kalendar R, Lee D, Schulman AH

    Java web tools for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis. Genomics. – 2011, 98(2): 137-144. DOI:10.1016/j.ygeno.2011.04.009

  • Muterko A, Kalendar R, Cockram J, Balashova I, SivolapYu.

    Discovery, evaluation and distribution of haplotypes and new alleles of Photoperiod-A1 gene in wheat. Plant Molecular Biology, 2015. DOI:10.1007/s11103-015-0313-2

  • Mandoulakani BA, Yaniv E, Kalendar R, Raats D, Bihamta MR, Schulman AH

    Development of IRAP and REMAP derived SCAR markers for marker-assisted selection of the stripe rust resistance gene Yr15 derived from wild emmer wheat. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(2): 211-219. DOI: 10.1007/s00122-014-2422-8

  • Moisy C, Schulman AH, Kalendar R, Pelsy F

    The Tvv1 retrotransposon family is conserved between plant genomes separated by over 100 million years. Theoretical and Applied Genetics, 2014, 127(5): 1223-1235. DOI:10.1007/s00122-014-2293-z

  • Разработка ПЦР технологий для фингерпринта и генотипирования растений, животных и человека, на основе последовательностей ретротранспозонов (IRAP, REMAP и iPBS технологии);
  • Идентификации новых классов ретротраспозонов для растений и животных;
  • Идентификация простых повторов и характеристика ДНК последовательностей методом лингвистического анализа;
  • Разработка компьютерных программ и алгоритмов для подбора ПЦР праймеров и проб, выравнивания и поиска простых и сложных повторов (микросателлиты и тандемы, транспозоны, ретротранспозоны);
  • Разработка компьютерных программ для Windows (FastPCR) и онлайн (Java Web PCR Tools).
  • Выделение ДНК и РНК из растительной и животной тканей любой сложности;
  • ДНК фингерпринт, генотипирование, и паспортизация генетического материала;
  • Детекция ДНК растений, животных и человека в продуктах питания и других в «сложных» образцах
  • Разработка молекулярных маркеров для растений и животных, на основе полиморфизма ретротранспозонов и некодирующей части генома;
  • Сервис по подбору любых праймеров для разных типов ПЦР (стандартный, многолокусный, количественный, LAMP, PCA и т.д.) и проб для микрочипов и ПЦР;
  • Разработка наборов для детекции ДНК интересующего организма;
  • Биоинформатика, генетический анализ;
  • Сертификация компьютерной программы FastPCR (подбор и анализ ПЦР праймеров, поиск и характеристика повторов и биоинформатика);
  • Разработка компьютерных программ для биоинформатики;
  • Подготовка научных кадров по специальности молекулярная биология, биоинформатика, программирование и сертификация;
  • Рецензия международных грантов и научных статей.

О нас

Республиканское государственное предприятие «Национальный центр биотехнологии» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан – ведущий биологический научный центр страны, реализующий государственную политику поддержки и развития биотехнологической отрасли - создан Указом Президента Республики Казахстан в 1993 г.

Последние новости

Подписаться

Подпишитесь на новости