Өсімдіктер геномикасы және биоинформатика зертханасы

Зертхана меңгерушісі

 

КАЛЕНДАР РУСЛАН НИКОЛАЕВИЧ

 
Биология ғылымдарының кандидаты,
генетика доценті (Хельсинки университеті)
 

 

Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
+7(7172) 70 75 17

 
 

УАҒА селекциялық-генетикалық институтының ғылыми қызметкері (Одесса), Хельсинки университеті биотехнология институтының ғылыми қызметкер), УАҒА агроэкология және биотехнология институтының аға ғылыми қызметкері (Киев), биотехнология институтының аға ғылыми қызметкері (Хельсинки ).

Молекулалық биология және генетика, биоинформатика саласындағы маман. 80-нен астам ғылыми жұмыстардың, 4 патенттің, 2 монографияның, 2 оқу құралының, 50-ден астам тезистердің және 6 компьютерлік бағдарламаның авторы.

Зерттеулер бағыттарыБасты басылымдарИнновациялық әзірлемелерҰсынылатын қызметтер
  • Өсімдіктердің геномдарын молекулалық-генетикалық зерттеулер, геномдардың салыстырмалы анализі және геномика;
  • Синтетикалық биология және биоинформатика (компьютерлік бағдарламалар әзірлеу, қайталауларды іздестіру, ДНҚ жүйеліліктерін теңестіру және кластерлеу және ПЦР әдістері), зерттелетін гендер мен геномдардың салыстырмалы анализі үшін деректер және бағдарламалық қамтамасыз ету базасын құру;
  • Интрондардың баламалы сплайсингін және көптүрлілігін зерттеу;
  • Ұтқыр элементтерді (ретротранспозондарды, транспозондарды) зерттеу және оларды молекулалық-генетикалық және эволюциялық зерттеулер үшін қолдану.
 
  • Kalendar R, Lee D, Schulman AH

    FASTPCR software for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis. Methods in Molecular Biology series: DNA Cloning and Assembly Methods, e. ed. Valla S., Lale R., – 2014, 1116: 271-302. ISBN 978-1-62703-763-1. DOI: 10.1007/978-1-62703-764-8_18

  • Kalendar R, Schulman AH 

    Transposon based tagging: IRAP, REMAP, and iPBS. Methods in Molecular Biology series: Molecular Plant Taxonomy. Protocols and applications, ed. Besse P., – 2014, 1115: 233-255. ISBN 978-1-62703-766-2. DOI: 10.1007/978-1-62703-767-9_12

  • Kalendar R, Lee D, Schulman AH

    Java web tools for PCR, in silico PCR, and oligonucleotide assembly and analysis. Genomics. – 2011, 98(2): 137-144. DOI:10.1016/j.ygeno.2011.04.009

  • Muterko A, Kalendar R, Cockram J, Balashova I, SivolapYu.

    Discovery, evaluation and distribution of haplotypes and new alleles of Photoperiod-A1 gene in wheat. Plant Molecular Biology, 2015. DOI:10.1007/s11103-015-0313-2

  • Mandoulakani BA, Yaniv E, Kalendar R, Raats D, Bihamta MR, Schulman AH

    Development of IRAP and REMAP derived SCAR markers for marker-assisted selection of the stripe rust resistance gene Yr15 derived from wild emmer wheat. Theoretical and Applied Genetics, 2015, 128(2): 211-219. DOI: 10.1007/s00122-014-2422-8

  • Moisy C, Schulman AH, Kalendar R, Pelsy F

    The Tvv1 retrotransposon family is conserved between plant genomes separated by over 100 million years. Theoretical and Applied Genetics, 2014, 127(5): 1223-1235. DOI:10.1007/s00122-014-2293-z

  • Ретротранспозондар жүйеліліктері (IRAP, REMAP және iPBS технологиялары) негізінде өсімдіктердің, жануарлардың және адамның фингерпринті және оларды генотиптеу үшін ПЦР технологияларын әзірлеу;
  • Өсімдіктер мен жануарлар үшін ретротраспозондардың жаңа топтарын сәйкестендірулер;
  • Қарапайым қайталауларды сәйкестендіру және лингвистикалық анализ әдісімен ДНҚ жүйеліліктерін сипаттау;
  • Праймерлерге және үлгілерге ПЦР таңдау, қарапайым және күрделі қайталауларды (микросателлиттер және  жиынтықтар, транспозондар, ретротранспозондар) теңестіру және іздестіру үшін компьютерлік бағдарламалар және алгоритмдер әзірлеу;
  • Windows (FastPCR) және онлайн (Java Web PCR Tools) үшін компьютерлік бағдарламалар әзірлеу.
  • Ретротранспозондардың және  гендердің кодталмайтын бөлігінің көптүрлілігі негізінде өсімдіктер мен жануарлар үшін молекулалық маркерлер әзірлеу;
  • Кез келген күрделіліктің өсімдікке және жануарға қатысты тіндерінен ДНҚ және РНК бөліп шығару;
  • ДНҚ фингерпринті, генетикалық материалды генотиптеу және паспорттандыру;
  • Өсімдіктердің, жануарлардың және адамның тағам өнімдеріндегі және басқа «күрделі» үлгілердегі ДНҚ детекциясы;
  • ПЦР-дің әр түрлі үлгілері (стандартты, көплокусты, сандық және т.с.с.) үшін кез келген праймерлер және микрочиптер мен  ПЦР үшін сынамалар таңдау жөніндегі сервис;
  • Мүдделі организмнің ДНҚ детекциясы үшін жиынтықтар әзірлеу;
  • FastPCR компьютерлік бағдарламасын сертификаттау (ПЦР праймерлерін іріктеу және талдау, қайталауларды іздестіру және сипаттау, биоинформатика);
  • Компьютерлік бағдарламалар әзірлеу;
  • Молекулалық биология және сертификаттау мамандығы бойынша ғылыми кадрлар даярлау;
  • Халықаралық гранттар мен ғылыми мақалалардың рецензиясы.

Біз туралы

Елдің биотехнология саласын мемлекеттік қолдау және дамыту саясатын іске асыратын жетекші биологиялық ғылыми орталық - «Қазақстан Республикасы Білім және ғылым министрлігінің Ғылым комитеті «Ұлттық биотехнология орталығы» республикалық мемлекеттік кәсіпорны (ҰБО) Қазақстан Республикасы Президентінің Жарлығымен 1993 жылы құрылды. Орталық биотехнология, биологиялық қауіпсіздік және экология саласындағы мемлекетпен қаржыландырылатын ғылыми-техникалық бағдарламаларды орындайды және үйлестіреді.

Соңғы жаңалықтар